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J-GLOBAL ID：201702224028889179   整理番号：17A1240058

InSourcerer:質量分析による未知代謝産物修飾を探索するためのハイスループット法【Powered by NICT】

InSourcerer: a high-throughput method to search for unknown metabolite modifications by mass spectrometry

著者 (12件)： Mrzic Aida (Department of Mathematics and Computer Science, University of Antwerp, Antwerpen, Belgium) ,  Mrzic Aida (Biomedical Informatics Research Network Antwerpen (biomina), University of Antwerp / Antwerp University Hospital, Antwerpen, Belgium) ,  Lermyte Frederik (Applied Bio & Molecular Systems, Flemish Institute for Technological Research (VITO), Mol, Belgium) ,  Lermyte Frederik (UA-VITO Center for Proteomics, University of Antwerp, Antwerpen, Belgium) ,  Lermyte Frederik (Department of Chemistry, University of Antwerp, Antwerpen, Belgium) ,  Vu Trung Nghia (Department of Mathematics and Computer Science, University of Antwerp, Antwerpen, Belgium) ,  Vu Trung Nghia (Biomedical Informatics Research Network Antwerpen (biomina), University of Antwerp / Antwerp University Hospital, Antwerpen, Belgium) ,  Valkenborg Dirk (Applied Bio & Molecular Systems, Flemish Institute for Technological Research (VITO), Mol, Belgium) ,  Valkenborg Dirk (UA-VITO Center for Proteomics, University of Antwerp, Antwerpen, Belgium) ,  Valkenborg Dirk (Interuniversity Institute for Biostatistics and Statistical Bioinformatics, Hasselt University, Hasselt, Belgium) ,  Laukens Kris (Department of Mathematics and Computer Science, University of Antwerp, Antwerpen, Belgium) ,  Laukens Kris (Biomedical Informatics Research Network Antwerpen (biomina), University of Antwerp / Antwerp University Hospital, Antwerpen, Belgium)
資料名： Rapid Communications in Mass Spectrometry  (Rapid Communications in Mass Spectrometry)
巻： 31  号： 17  ページ： 1396-1404  発行年： 2017年 
JST資料番号： T0695A  ISSN： 0951-4198  CODEN： RCMSEF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 根拠:質量分析を用いて,既知代謝産物構造の解析は,系統的ハイスループット様式で実現可能になってきた。それにもかかわらず,これまで知られていない構造の確認は大きな課題である,多くの未同定変異体は予期せぬ修飾を受けたことが知られている分子に由来するため,部分的に。,未知代謝産物修飾の発見とハイスループット様式で共役代謝産物イソ型のための方法を提示した。【方法】法を用いて,弱く結合した修飾の喪失を誘導するユーザ制御型イオン源内フラグメンテーションに基づいている。これはイオン源内フラグメンテーション及び衝突誘起解離(CID)からの生成物イオンの比較を行った。対角MS~2MS~3マッチングは,未知代謝産物修飾だけでなく,下部構造類似性の検出を可能にした。法は,イオン源内フラグメンテーションの利点に大きく依存し,「magicallyの能力は未知修飾を明らかとして,インソースと魔法使いのportmanteau,inSourcererと命名した。【結果】法は十五の異なるサイトカイニン標準のセットを用いて評価した。インソースフラグメンテーションとCIDによる生成物イオンを比較した。階層的クラスタリングは通常の部分構造の存在のために良い一致を明らかにした。植物葉抽出物,全15の標準品の混合物を添加した,を用いて,複雑な混合物中のこれらの標準を検出し,同様に既に植物材料中に存在する化合物を確実に同定する方法の能力を実証することであった。【結論】ここでは,フラグメンテーションモデルと計算アルゴリズムと古典的液体クロマトグラフィー/質量分析(LC/MS)ワークフローを組み込んだ方法を提示した。法の概念を構築した仮定が有効であることが示された,この方法はイオン源内フラグメンテーションは特定構造類似性と修飾の発生を示すために使用できることを示した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： マッチング ,  フラグメンテーション ,  *質量分析 ,  LC-MS分析 ,  共役 ,  衝突誘起解離 ,  *代謝産物 ,  ワークフロー ,  類似性 ,  イオン ,  サイトカイニン ,  イオン源
準シソーラス用語： 抽出物 ,  階層的クラスタリング ,  *ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 有機化合物の各種分析  (CC08034J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 質量分析 ,  代謝産物 ,  修飾 ,  探索 ,  ハイスループット法