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J-GLOBAL ID:201702224099088455   整理番号:17A1674524

肝がんHepG2細胞から誘導されるエキソソームプロテオームの生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis of exosome proteome derived from hepatic carcinoma HepG2 cells
資料名:
巻: 34  号:ページ: 321-326  発行年: 2017年 
JST資料番号: C3482A  ISSN: 1005-930X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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【目的】本研究の目的は,肝癌HepG2細胞と正常肝細胞HL-7702から誘導されたエキソソームプロテオームを分析することであり,肝細胞癌(HCC)の発癌における重要な因子を探ることである。【方法】HepG2およびHL-7702細胞を培養し,培養上清からエキソソームサンプルを得て,検証した。LTQ-Orbitrap Elite質量分析を,肝癌細胞と正常肝細胞から誘導されたエキソソームプロテオームを分析し,同定するために適用し,それは,肝癌細胞を特異的に発現する蛋白質を探索することであった。その上,遺伝子オントロジー(GO),蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワーク,および経路濃縮を構築し,肝臓癌細胞を特異的に発現する蛋白質を分析した。【結果】:【結果】のうち,HL-7702のエキソソームは,366の蛋白質を発現し,HepG2の発現は,特異的ペプチドが,代謝,増殖,および局在接着機能に集中しているという条件下での生物情報学的解析により,選択された,そして,PPIネットワークを形成させたことを明らかにした。経路解析と結合して,ACTN1,FN1,RAC1およびGSNは,HCCの重要なシグナル伝達経路に関与することがわかった。PPIネットワークではない26の標的蛋白質を,それぞれ含まれる経路を分析した。AKR1C2およびC5は,HCCCの異なる重要なシグナル伝達経路に関与することが見出され,エキソソームプロテオミクスは,肝癌細胞由来の特異的蛋白質の供給源を提供する。生物情報学的分析と組み合わせると,HCCの発癌に関連する重要な分子を明らかにし,HCCバイオマーカーの研究のための新しい考え方を提供することができる。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (3件):
分類
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蛋白質・ペプチド一般  ,  分子・遺伝情報処理  ,  生物学的機能 
タイトルに関連する用語 (5件):
タイトルに関連する用語
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