オックスフォードナノ細孔MinION配列決定とゲノムアセンブリ【Powered by NICT】

Lu Hengyun; Giordano Francesca; Ning Zemin

文献

J-GLOBAL ID：201702224336551888 整理番号：17A0200224

オックスフォードナノ細孔MinION配列決定とゲノムアセンブリ【Powered by NICT】

Oxford Nanopore MinION Sequencing and Genome Assembly

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巻： 14 号： 5 ページ： 265-279 発行年： 2016年
JST資料番号： C2620A ISSN： 1672-0229 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：英語 (EN)

ゲノム配列決定の革命は成功secondgeneration配列決定(SGS)技術後に続いている。Pacific Biosciences社製PacBio(PacBio)によって導かれた,第三世代シークエンシング(TGS)技術は急速に進行しており,小ゲノム解析のためのデータを提供できる唯一の一旦技術から,又は標的スクリーニングを行うための,等身大ゲノムのための高品質de novoアセンブリと構造変化検出を約束するものに移行している。2014年,MinION,ナノ細孔技術を用いた最初の商業用シーケンサ,オックスフォードナノ細孔技術(ONT)により放出された。MinIONはDNA鎖は生物学的細孔を通過する発生した電気伝導率の変化を測定することによりDNA塩基を同定した。データ作成におけるその携帯性,入手可能性,と速度は,実時間アプリケーションに適している,長いreadシーケンサーMinIONの放出は,ゲノミクスコミュニティにおける非常に興奮と関心を集めている。de novoゲノム集合体はSGSデータから作成した安価にできるが,集合の連続性はしばしば比較的低い,長い反復を扱うために短い読み込みの限られた能力に起因した。組立品質はTGS長リードを用いることによって著しく改善できる,反復領域は,より長い配列長を用いてに容易に拡張できるので,塩基レベルで高い誤り率を持つにもかかわらず。ナノ細孔配列解読法の可能性は迅速で信頼性のある配列が必要であるが,資源は限られている場所でゲノムサーベイランスにおけるさまざまな研究により実証した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

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遺伝学研究法 , 遺伝子の構造と化学

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