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J-GLOBAL ID：201702225244473092   整理番号：17A1606710

rqt 遺伝子レベルメタ分析のためのRパッケージ

rqt: an R package for gene-level meta-analysis

著者 (3件)： ZHBANNIKOV Ilya Y. (Duke Univ., NC, USA) ,  ARBEEV Konstantin G. (Duke Univ., NC, USA) ,  YASHIN Anatoliy I. (Duke Univ., NC, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 19  ページ： 3129-3130  発行年： 2017年10月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： GWASの最近の進歩にもかかわらず,単一変異体に対するより全遺伝子に対する効果サイズおよび対応するp値の計算は重要な問題である。遺伝子レベルGWASメタ分析を与えるRパッケージ,rqtを開発した。このパッケージは,バイオインフォーマティクスパイプラインへ容易に含まれるかまたは単独で用いられる。3つのデータセットCHS,FHSおよびLOADFSからのアルツハイマー病の解析へ,このツールを応用した。3つのアルツハイマー病研究のメタ分析からの試験結果は,適合試験に対するその応用性を示した。

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *メタ分析 ,  *プログラミング言語 ,  *プログラムパッケージ ,  ゲノムワイド関連解析 ,  突然変異体 ,  数値 ,  確率 ,  計算 ,  情報科学 ,  生物学 ,  パイプライン処理 ,  ソフトウェア ,  集合 ,  データ ,  Alzheimer病 ,  通信試験 ,  ソフトウェア仕様 ,  プロトコル
準シソーラス用語： *Rパッケージ ,  GWAS ,  変異体 ,  p値 ,  バイオインフォマティクス ,  ソフトウェアパイプライン ,  データセット ,  適合試験

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  応用プログラミング言語  (JD03052Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 遺伝子 ,  メタ分析 ,  Rパッケージ