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J-GLOBAL ID：201702226011124621   整理番号：17A1402475

腫瘍純度を考慮することは,DNAメチル化データからの癌サブタイプ分類を改善する

Accounting for tumor purity improves cancer subtype classification from DNA methylation data

著者 (5件)： ZHANG Weiwei (Shanghai Normal Univ., Shanghai, CHN) ,  ZHANG Weiwei (East China Univ. Technol., Jiangxi, CHN) ,  FENG Hao (Emory Univ., GA, USA) ,  WU Hao (Emory Univ., GA, USA) ,  ZHENG Xiaoqi (Shanghai Normal Univ., Shanghai, CHN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 17  ページ： 2651-2657  発行年： 2017年09月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 臨床現場で得られる固形腫瘍組織試料は癌細胞と正常細胞の混合物であり,それらから得られるデータは混合したシグナルであるため,癌組織試料の腫瘍純度を適切に考慮しないとクラスタリングの結果が偏る。本研究では,モデルに基づくクラスタリング法InfiniumClustと,腫瘍純度を考慮して腫瘍サブタイプを推論するためDNAメチル化マイクロアレイデータを用いるR関数を開発した。InfiniumClustは,https://cran.r-project.org/web/packages/InfiniumPurify/index.htmlにて利用可能である。

シソーラス用語： メチル化 ,  *腫瘍 ,  分類 ,  *純度 ,  *クラスタ化
準シソーラス用語： *DNAメチル化 ,  *癌分類 ,  *クラスタリング

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  腫ようの診断  (GE03020J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 腫瘍 ,  純度 ,  DNAメチル化 ,  癌 ,  サブタイプ ,  分類