生命科学データの再現性のあるクロスドメイン解析のためのKNIME【Powered by NICT】

Fillbrunn Alexander; Fillbrunn Alexander; Dietz Christian; Pfeuffer Julianus; Rahn Rene; Landrum Gregory A.; Berthold Michael R.; Berthold Michael R.; Berthold Michael R.

文献

J-GLOBAL ID：201702226245331090 整理番号：17A1560139

生命科学データの再現性のあるクロスドメイン解析のためのKNIME【Powered by NICT】

KNIME for reproducible cross-domain analysis of life science data

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資料名：
巻： 261 ページ： 149-156 発行年： 2017年
JST資料番号： A0456C ISSN： 0168-1656 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

生命科学における実験は,しばしば質量分析,次世代配列決定,または画像処理のようなドメインの品種からのツールを含んでいる。これらツール間のデータを通過するしばしばデータフロー,データ変換,統計解析を制御するための複雑なスクリプトを含んでいる。このようなスクリプトはプラットフォーム依存すること傾向が,実験が進むにつれて成長する傾向があるとされていない十分に文書化され,実験の再現性を妨げるという事実。KNIME分析プラットフォームのようなワークフローシステムは接続ツールグラフと異なるオペレーティングシステムに同じ結果を保証するためのプラットフォームを提供することにより,これらの問題を解決することを目的とした。オープンソースソフトウェアとして,KNIMEは科学者とプログラマは科学界に自分自身の拡張を提供することを可能にした。本レビュー論文では,データ探査,解析および可視化を単純化し,KNIMEの統一データモデルによる相互運用可能なことを生命科学から選択された拡張を提示した。さらに,生命科学で一般的に用いられ,KNIMEへの類似点と相違点を強調する他のワークフローシステムと名付けた。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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著者キーワード (3件)： , ,

分子・遺伝情報処理 , 遺伝子の構造と化学

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