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J-GLOBAL ID：201702226364075679   整理番号：17A1438273

PMP22に向けてその正の影響を有する潜在的選択薬物を同定するための計算論的アプローチ【Powered by NICT】

A Computational Approach to Identify a Potential Alternative Drug With Its Positive Impact Toward PMP22

著者 (2件)： Agrahari Ashish Kumar (Department of Integrative Biology, School of BioSciences and Technology, VIT University, Vellore, Tamil Nadu 632014, India) ,  C George Priya Doss (Department of Integrative Biology, School of BioSciences and Technology, VIT University, Vellore, Tamil Nadu 632014, India)
資料名： Journal of Cellular Biochemistry  (Journal of Cellular Biochemistry)
巻： 118  号： 11  ページ： 3730-3743  発行年： 2017年 
JST資料番号： D0326B  ISSN： 0730-2312  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 末梢ミエリン蛋白質22(PMP22)の変異は,末梢神経系の最も一般的な遺伝性神経障害であるシャルコー・マリー・トゥース1A型(CMT1A,CMT1の亜型)疾患をもたらす。本研究では,PMP22遺伝子の最も有害な非同義SNP(nsSNP)をスクリーニングと同定のための一連のin silico予測法を使用した。48nsSNPのうち,PMP22と関連する五nsSNP(L16P,L19P,T23R,W28R,L147R)は,蛋白質は非常に有害なものと不安定であると予測された。可能な構造-機能関係を調べるために,著者らはPMP22蛋白質の結晶化構造の非存在下での三次元構造モデルを予測するためのCABS倍サーバを用いたab initioモデリング戦略を採用した。Cytoscape3.4.0プラグイン統合複合形質ネットワーク界面(iCTNet)を用いたPMP22遺伝子の可能性のある薬物遺伝子相互作用を同定した。前述のツールから得られた22種類の化合物を更なる分析のために強力な薬物分子をスクリーニングして同定しMolinspirationとOSIRISプログラムに供した。優れたバイオアベイラビリティと薬物に関連した特性を持つ五化合物を分子ドッキングシミュレーション研究のために選択した。はそれらの対応する位置での五変異体構造をモデル化し,それらの相互作用パターンと結合効率を解析するためにAutoDockツール(ADT)バージョン1.5.6とArgusLab4.0.1ツールを用いた分子ドッキングシミュレーション解析を行った。計算研究から得られた結果に基づいて,著者らは,エストラジオールが近い将来に生物学者から大きな注意を要するCMT1A患者を治療するための選択の可能性がある薬物であることを予測した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： モデリング ,  *タンパク質 ,  末梢神経系 ,  相互作用 ,  ネットワーク ,  結晶化 ,  界面 ,  予測技法 ,  バイオアベイラビリティ
準シソーラス用語： ドッキングシミュレーション ,  分子ドッキングシミュレーション ,  三次元構造 ,  in silico ,  PMP22遺伝子 ,  *PMP22 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： PMP22 ,  CMT1A ,  nsSNP ,  仮想スクリーニング ,  ABINITIOモデリング ,  ADMET ,  ドッキングシミュレーション

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (4件)： PMP22 ,  薬物 ,  同定 ,  計算