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J-GLOBAL ID：201702226395986878   整理番号：17A0307030

GTB オンラインゲノム許容性ブラウザ

GTB - an online genome tolerance browser

著者 (5件)： SHIHAB Hashem A. (Univ. Bristol) ,  ROGERS Mark F. (Univ. Bristol) ,  FERLAINO Michael (Univ. Bristol) ,  CAMPBELL Colin (Univ. Bristol) ,  GAUNT Tom R. (Univ. Bristol)
資料名： BMC Bioinformatics (Web)  (BMC Bioinformatics (Web))
巻： 18  号： Jan  ページ： 18:20 (WEB ONLY)  発行年： 2017年01月 
JST資料番号： U7025A  ISSN： 1471-2105  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:一塩基多型(SNV)の効果を予測できる正確な方法は,重要性をさらに増していると考えられる。さらなる研究のためのヒトゲノム全域でのSNVの特定と優先付けを支援するために設計された過多なin silicoアルゴリズムが存在する。しかしながら,ゲノムの変異に対する予測された許容性,あるいはこれら方法の間の類似性を視覚化するためのいかなるツールも存在しない。結果:変異に対するゲノムの予測された許容性を視覚化するためのオンラインゲノムブラウザであるゲノム許容性ブラウザ(GTB,http://gtb.biocompute.org.uk)を提案した。本サーバーは,13個のゲノムワイド予測アルゴリズムおよび保存スコア,12個の非同義予測アルゴリズムおよび四つの癌特異的アルゴリズムを含む複数のin silico予測アルゴリズムおよび保存スコアを要約した。結論:GTBは,ユーザーが複数の予測アルゴリズムの間の類似性および相違を視覚化し,追加的トラックの追跡としてユーザー自身のデータをアップロードすることを可能にし,それにより可能性のある関心領域の迅速な特定を容易にする。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *応用プログラム ,  計算機アルゴリズム ,  ゲノム ,  *一塩基多型 ,  解析 ,  *類似性 ,  可視化 ,  計算機システム ,  ゲノムワイド関連解析 ,  範囲 ,  *アルゴリズム ,  突然変異 ,  病原性
準シソーラス用語： *Webブラウザ ,  オンラインアルゴリズム ,  in silico解析 ,  *遺伝的類似性 ,  視覚化 ,  Webサーバ ,  ゲノムワイド相関解析 ,  関心領域 ,  *予測アルゴリズム

分類 (4件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  理論生物学一般  (EA02010D) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： GTB ,  オンライン ,  ゲノム ,  許容性 ,  ブラウザ