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J-GLOBAL ID：201702226553473881   整理番号：17A0299298

潜在性結核菌感染者の血漿長鎖非コードRNA発現プロファイルの差異分析【JST・京大機械翻訳】

Differential expression analysis of long non-coding RNA in the plasma of patients with latent tuberculous infection

著者 (6件)： Ou Qingye (Faculty of Health Sciences,Macau University of Science and Technology) ,  Gu Dayong (深zhen市検験検疫科学研究院) ,  Zhou Jianzhong (珠海市慢性病防治中心) ,  Dong Qiulan (珠海市慢性病防治中心) ,  Liang Lijuan (珠海市慢性病防治中心) ,  Lam Christopher Wai Kei (Faculty of Health Sciences,Macau University of Science and Technology)
資料名： Zhonghua Jianyan Yixue Zazhi  (Zhonghua Jianyan Yixue Zazhi)
巻： 39  号： 11  ページ： 857-863  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2341A  ISSN： 1009-9158  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:長鎖非コードRNA(LNCRNA)の潜在性結核菌感染における差次的発現を検討する。方法:2015年1月から6月までの間に、珠市の慢性疾患予防センターで診断された潜在性結核菌感染患者33例(症例群)を選択し、標準範囲は18~40歳で、診断された塗抹陽性肺結核症例は密接な接触者であった。胸部画像検査は正常であった。皮膚結核菌試験は強い陽性を示した。6ケ月後に活動性肺結核を認めた。対照群は同施設の健常者の血漿33名を登録し、標準を年齢範囲18~40歳とし、肺結核或いはその他の肺疾患を排除し、皮膚結核菌試験は陰性であった。症例群と対照群の各3例はLNCRNAチップ実験に用い、30例はRT-PCR検証実験に用いた。TRIZOL法により総RNAを抽出した後、LNCRNAチップ技術を用いてハイスループット検出を行い、潜在性結核菌感染者のLNCRNA遺伝子発現プロファイルを確立した。6つの差次的発現を持つLNCRNAをスクリーニングし,リアルタイム定量PCR技術を用いて,30例の拡大試料中で検証を行い,高感度で高特異性のバイオマーカーを得た。遺伝子機能解析と遺伝子経路解析を用いて,差次的遺伝子の発現を分析した。データの正規性試験はKOLMOGOROV-SMIROV(K-S)、正規分布データの二つのサンプルの平均数をT検定を採用し、複数のサンプルの平均数は単因子分散分析を採用し、二種類のサンプルの比較はX2検定を用いた。【結果】特異的差次的発現はLNCRNA個であり,合計LNCRNA%を占め,そのうち819個は上方制御され,666個は上方制御された。ENST(T=10.92,P<0.001),TCONS_00016510(T=2.98,P=0.004)は,潜在性結核菌感染者の血漿において有意に上方制御された。NR_034120の発現は有意に減少した(T=-16.63,P<0.001)。遺伝子機能の分析において、アップレギュレーションされたMRNAのうち、382個の遺伝子が生物学的プロセスを濃縮、60個の遺伝子が細胞モジュールを濃縮、43個の遺伝子が分子機能を濃縮いる。ダウンレギュレーションされたMRNAのうち、276個の遺伝子は生物学的プロセスを濃縮、55個の遺伝子は細胞の成分を濃縮し、55個の遺伝子は分子の機能を濃縮いる。遺伝子経路解析により、アップレギュレーションされたMRNAは主に7本の生物学的経路を濃縮、ダウンレギュレーションされたMRNAは主に7本の生物学的経路を濃縮いる。結論:LNCRNAは潜在性結核菌感染の血漿中に異常発現し、INCRNASが潜伏性結核菌感染の分子調節過程に参与することを示唆した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： バイオマーカー ,  RT-PCR法 ,  肺結核 ,  *感染 ,  *結核菌 ,  遺伝子 ,  アップレギュレーション ,  高感度 ,  機能分析 ,  患者 ,  *血漿 ,  ダウンレギュレーション
準シソーラス用語： 特異性 ,  差次的遺伝子発現 ,  *遺伝子発現プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Latent tuberculosis ,  RNA ,  long noncoding

分類 (2件)： 呼吸器の疾患  (GI03000Z) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (8件)： 潜在性 ,  結核菌 ,  感染 ,  血漿 ,  長鎖非コードRNA ,  発現プロファイル ,  差異 ,  分析