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J-GLOBAL ID：201702227551817815   整理番号：17A1830217

SVMDLF:ジペプチジルペプチダーゼ4阻害剤の予測のための新しいR言語に基づくWebアプリケーション【Powered by NICT】

SVMDLF: A novel R-based Web application for prediction of dipeptidyl peptidase 4 inhibitors

著者 (6件)： Chandra Sharat (Academy of Scientific and Innovative Research (AcSIR), CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow, India) ,  Chandra Sharat (Molecular and Structural Biology Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow, India) ,  Pandey Jyotsana (Biochemistry Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow, India) ,  Tamrakar Akhilesh K. (Biochemistry Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow, India) ,  Siddiqi Mohammad Imran (Academy of Scientific and Innovative Research (AcSIR), CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow, India) ,  Siddiqi Mohammad Imran (Molecular and Structural Biology Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow, India)
資料名： Chemical Biology & Drug Design  (Chemical Biology & Drug Design)
巻： 90  号： 6  ページ： 1173-1183  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1436A  ISSN： 1747-0277  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ジペプチジルペプチダーゼ4(DPP4)は抗糖尿病薬に対する良く知られた標的である。しかし,現在利用可能なDPP4阻害剤スクリーニングアッセイは費用がかかり,大きな労働力を要する。新しいリード化合物の発見のためのDPP4阻害剤の活性を予測するためのロバストなin silico法を作り出すことが重要である。ここでは,サポートベクトルマシン(SVM)モデルに基づいて,DPP4阻害剤の予測は,in vitro生物学的評価により確認したを予測するRベースWebアプリケーションSVMDLF(SVMベースDPP4鉛ファインダ)を導入した。MACCS構造フィンガープリントにより生成された最良のモデルは,外部試験セットのためのテストセット0.883Matthews相関係数は0.87であった。約53,000化合物をMaybridgeデータベースをスクリーニングした。更なる生物活性アッセイでは,六種の化合物がshortlistedし,六ヒットの,三化合物は8.01から10.73μmの範囲のIC_50値と有意なDPP4阻害活性を示した。この応用は,DPP4阻害剤予測のための新しい単一ページR ベースWebアプリケーションであるOpenCPUサーバアプリケーションである。SVMDLFは自由に入手できるとhttp://svmdlf.net/ocpu/library/dlfsvm/www/and http://www.cdri.res.in/svmdlf/で全ユーザに開放された。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： データベース ,  生物活性 ,  血糖降下薬 ,  in vitro実験 ,  サポートベクトルマシン ,  ロバスト性 ,  相関係数 ,  *予測
準シソーラス用語： 生物学的評価 ,  in silico ,  リード化合物 ,  ジペプチジルアミノペプチダーゼIV阻害剤 ,  *Webアプリケーション ,  *阻害剤 ,  *ジペプチジルペプチダーゼ4 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ジペプチジルペプチダーゼ4 ,  R言語に基づくWebアプリケーション ,  サポートベクトルマシン ,  仮想スクリーニング

分類 (1件)： 糖質代謝作用薬の基礎研究  (GW13020Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： ジペプチジルペプチダーゼ4 ,  阻害剤 ,  予測 ,  R言語 ,  Webアプリケーション