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J-GLOBAL ID：201702227616959307   整理番号：17A1431181

IlluminaのFGx法医学的ゲノミクスシステムを用いた4種の主要な個体群の個体群と性能分析【Powered by NICT】

Population and performance analyses of four major populations with Illumina’s FGx Forensic Genomics System

著者 (6件)： Churchill Jennifer D. (Center for Human Identification, University of North Texas Health Science Center, 3500 Camp Bowie Blvd., Fort Worth, TX 76107, USA) ,  Novroski Nicole M.M. (Center for Human Identification, University of North Texas Health Science Center, 3500 Camp Bowie Blvd., Fort Worth, TX 76107, USA) ,  King Jonathan L. (Center for Human Identification, University of North Texas Health Science Center, 3500 Camp Bowie Blvd., Fort Worth, TX 76107, USA) ,  Seah Lay Hong (Department of Chemistry Malaysia Kuching, Ministry of Science, Technology and Innovation (MOSTI) Malaysia) ,  Budowle Bruce (Center for Human Identification, University of North Texas Health Science Center, 3500 Camp Bowie Blvd., Fort Worth, TX 76107, USA) ,  Budowle Bruce (Center of Excellence in Genomic Medicine Research (CEGMR), King Abdulaziz University, Jeddah, Saudi Arabia)
資料名： Forensic Science International: Genetics  (Forensic Science International: Genetics)
巻： 30  ページ： 81-92  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3148A  ISSN： 1872-4973  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： MiSeq FGx法医学ゲノミクスシステム(イルミナ)は増幅と59STR,94同一性の有益なSNPs,情報54祖先SNP,および24の表現型の有益なSNPsの大規模並行配列決定を可能にした。対立遺伝子頻度と人口統計データは,四種類の主要な集団(中国,アフリカ系アメリカ人,USコーカサス人と南西ヒスパニック)に対するこのパネルに含まれる172SNP遺伝子座に対して発生させた。単一遺伝子座および複合ランダム一致確率値は同一性の有益なSNPsに対して発生させた。四集団すべてにわたる平均複合STRと有益な同一性SNPランダム一致確率(独立性を仮定)は長さと配列に基づくSTR対立遺伝子を持つ1.75e,67および2.30e71であった。祖先と表現型予測は各試料で発生した祖先情報と情報表現型SNPプロファイルに基づくForenSeq普遍的解析システム(UAS,Illumina)を用いて得た。さらに,プロファイル完全性,深さ,相対遺伝子座性能,対立遺伝子被覆率を含む性能指標を本研究に含まれる725の試料を評価し,詳述した。このパネルに含まれるいくつかの遺伝的マーカーは他よりも著しく良好な性能を示したが,個体群の性能は一般的に一致した。本研究に含まれる性能と集団データは正確で信頼性のあるプロファイルを作成し,内部検証研究と実装を考慮した実験室のための価値ある背景情報を提供することを支持した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *性能分析 ,  信頼性 ,  予測 ,  統計データ ,  一塩基多型 ,  中華人民共和国 ,  *法医学 ,  表現型 ,  *個体群 ,  対立遺伝子 ,  遺伝子頻度 ,  完全性 ,  カフカス地方
準シソーラス用語： 遺伝子マーカ ,  アフリカ系アメリカ人 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： ForenSeq ,  DNA署名調製キット ,  FGx法医学的ゲノミクスシステム ,  主要な個体群 ,  STR ,  SNP ,  対立遺伝子頻度 ,  集団遺伝学

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： 法医学 ,  ゲノミクス ,  個体群 ,  個体 ,  性能分析