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J-GLOBAL ID：201702228314402399   整理番号：17A1738584

FDPS入門(3)

著者 (1件)： 野村昴太郎 (理研 計算科学研究機構)
資料名： アンサンブル  (分子シミュレーション学会誌)
巻： 19  号： 4  ページ： 261-266  発行年： 2017年10月31日 
JST資料番号： L8101A  ISSN： 1884-6750  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 本連載では,我々が開発・公開している多体シミュレーションプログラム開発フレームワーク「FDPS(Framework for Developpint Particle Simulators)」の使い方を紹介します。連載第三回の今回は,FDPSを利用する際に,どのように分子内の原子間距離の拘束や周期境界条件下での長距離相互作用を取り扱うかをサンプルプログラムを解説しながら紹介します。(著者抄録)

シソーラス用語： シミュレータ ,  *核間距離 ,  *遠距離相互作用 ,  *シミュレーション ,  システムインタフェイス ,  分子動力学 ,  フレームワーク【ソフトウェア開発】
準シソーラス用語： *多体シミュレーション ,  *プログラム開発 ,  長距離相互作用 ,  *粒子シミュレーション ,  MPI【インタフェイス】 ,  OpenMP ,  FDPS

分類 (1件)： 分子の幾何学的構造一般  (BH05021S)

引用文献 (5件)：

• 1 X. Wu and B. R. Brooks, J. Chem. Phys., 122, 044107 (2005).
• 2 K. Z. Takahashi, J. Comput. Chem., 35, 865 (2014).
• 3 T. Nozawa, K. Z. Takahashi, T. Narumi, K. Yasuoka, J. Comput. Chem., 36, 2406 (2015).
• 4 K. Z. Takahashi, T. Narumi, K. Yasuoka, J. Chem. Phys., 135, 174198 (2011).
• 5 A. Kawai and J. Makino, Astrophys. J., 550, L143 (2001).

タイトルに関連する用語 (1件)： FDPS