ポケット検出と相互作用重み付き配位子類似性検索はミオシリン1胸椎黄色靭帯骨化症,緑内障に関与する蛋白質のための新規高親和性結合をもたらす【Powered by NICT】

Srinivasan Bharath; Tonddast-Navaei Sam; Skolnick Jeffrey

文献

J-GLOBAL ID：201702228687810403 整理番号：17A1463447

ポケット検出と相互作用重み付き配位子類似性検索はミオシリン1胸椎黄色靭帯骨化症,緑内障に関与する蛋白質のための新規高親和性結合をもたらす【Powered by NICT】

Pocket detection and interaction-weighted ligand-similarity search yields novel high-affinity binders for Myocilin-OLF, a protein implicated in glaucoma

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巻： 27 号： 17 ページ： 4133-4139 発行年： 2017年
JST資料番号： W0248A ISSN： 0960-894X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

伝統的構造と配位子ベースの仮想遮蔽法を構造と配位子結合情報の入手可能性に依存している。この限界を克服するために,ハイブリッド法は似た褶曲構造を共有する蛋白質からの配位子結合情報の抽出と,進化的関係に依存することを開発した。しかし,それらは蛋白質の選択されたポケットを標的とすることはできない。これを解決するために,ポケット中心仮想配位子スクリーニング法が必要である。,緑内障に関与するヒトミオシリンのオルファクトメジンドメインのための小分子結合剤を予測するための仮想配位子スクリーニングへのポケットと配位子の類似性に基づくアプローチの新しい反復実装を採用した。蛋白質の小分子結合剤は蛋白質の凝集,緑内障中に一般的に見られるを妨げる可能性がある。myoc OLFに示差走査蛍光定量法を用いた予測の実験的評価は,12.7%の成功率で7ヒットをもたらした;最良ヒットは99nMの解離定数を有していた。結合に関与するようであったことを最良の配位子の重要な官能基に整合させることにより,最良のヒットの親和性は高ナノモルとピコモル範囲からほぼ10,000倍改善された。このように,本研究では,医学的に重要な緑内障関連蛋白質についての方法論の予備的検証を提供した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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高分子担体・触媒反応 , 遷移金属錯体一般

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