文献

J-GLOBAL ID：201702229275492616   整理番号：17A0381869

薬用植物Lonicera japonica (スイカズラ)の完全な葉緑体ゲノム:ゲノム再編成,イントロン利益と損失,および系統的研究への含意

Complete Chloroplast Genome of Medicinal Plant Lonicera japonica: Genome Rearrangement, Intron Gain and Loss, and Implications for Phylogenetic Studies

著者 (8件)： HE Liu (Peking Union Medical Coll., Beijing, CHN) ,  QIAN Jun (Peking Union Medical Coll., Beijing, CHN) ,  LI Xiwen (Peking Union Medical Coll., Beijing, CHN) ,  LI Xiwen (Acad. of Chinese Medical Sci., Beijing, CHN) ,  SUN Zhiying (Peking Union Medical Coll., Beijing, CHN) ,  XU Xiaolan (Peking Union Medical Coll., Beijing, CHN) ,  CHEN Shilin (Peking Union Medical Coll., Beijing, CHN) ,  CHEN Shilin (Acad. of Chinese Medical Sci., Beijing, CHN)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 22  号： 2  ページ： WEB ONLY  発行年： 2017年02月 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Lonicera japonica (スイカズラ),北アメリカおよび東アジアにおける一般的観賞および薬用植物,の完全な葉緑素(CP)ゲノムを,配列決定して,分析した。L.japonica cpゲノムの長さは,155,078 bpであり,それぞれ23,774 bpの,一対の側生反複領域(IraおよびIRb)ならびに大規模(LSC,88,858 bp)および小型(SSC,18,672 bp)単コピー領域を含む。合計129の遺伝子を,cpゲノムにおいて同定した,その内16を,IR領域の中で複製した。他の植物CPゲノムに相関的で,L.japonica cpゲノムは,trnI-CAUとtrnN-GUUの間で独特の再配列を持った。L.japonica cpDNAで,IR領域から,rps19,rpl2およびrpl23はLSC領域へ移る。IR領域におけるycf1 pesudogeneは失われる,そして,1複写だけはSSC領域に位置する。遺伝子配置および遺伝子およびイントロン含有量がわずかに異なることを,他のcpゲノムによるL.japonicaの比較cp DNA配列分析は,明らかにする。ycf2およびrps18遺伝子におけるイントロンを,初めて発見した。4つの遺伝子(ClpP,petB,petDおよびrpl16)は,イントロンを失った。しかし,そのゲノム構造,GC含量およびコドン利用性は,典型的被子植物CPゲノムのそれらに類似だった。すべての優先同義コドンが,A/Tを有する利用コドン終末であるとわかった。rich遺伝子の配列は,非コード1でよりコード領域で,豊富でなかった。L.japonicaがAraliaceae(ウコギ科)種の姉妹であるという考えを,71の蛋白質コード遺伝子に基づき系統解析は,支援した。cpDNA発生の理解に寄与するL.japonica cpゲノムの独特特性を,本研究は同定した。それは,この薬用植物の系統発生および特異的バーコーディングの価値ある情報を提供する。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *スイカズラ科 ,  *薬用植物 ,  *ゲノム ,  遺伝子再編成 ,  イントロン ,  北アメリカ ,  東アジア ,  *ヌクレオチド配列 ,  構成 ,  配置 ,  配列 ,  DNA【核酸】 ,  遺伝情報 ,  頻度 ,  ウコギ科 ,  解析 ,  系統発生
準シソーラス用語： Lonicera japonica ,  *葉緑体ゲノム ,  ゲノム再編成 ,  遺伝子配列決定 ,  再配列 ,  cpDNA ,  ゲノム構造 ,  コドン利用性 ,  系統解析

分類 (3件)： 植物分類学  (EH01030N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  発生,成長,分化  (EH02030U)

タイトルに関連する用語 (10件)： 薬用植物 ,  スイカズラ ,  葉緑体ゲノム ,  ゲノム再編成 ,  イントロン ,  利益 ,  損失 ,  系統 ,  研究 ,  含意