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J-GLOBAL ID：201702229504705951   整理番号：17A1670291

臨床検体におけるウイルス病原体の直接同定のための改良されたバーコード化オリゴヌクレオチドプライマーに基づく次世代配列決定法【JST・京大機械翻訳】

資料名： Biomedical and Environmental Sciences  (Biomedical and Environmental Sciences)
巻： 30  号： 1  ページ： 22-34  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2560A  ISSN： 0895-3988  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【目的】臨床検体における高いコスト,複雑な処置,膨大なデータ分析,および高いバックグラウンドノイズなどの一般的なNGSの臨床使用を妨げるため,臨床検体におけるウイルス病原体の正確な同定のための実行可能で費用効果のある次世代配列決定(NGS)法を提供する。【方法】細胞培養材料または臨床試料からのウイルスの使用を,改良されたNGS法によって同定し,そして,1つのチューブ混合物の,非コード化ライブラリの構築および配列解析により,両コード化プライマーセットは,複数のウイルス病原体の同時捕獲に有用であることを示した。さらに,この改良されたヘキサヌクレオチドプライマーに基づくNGSアプローチを用いた臨床試験片の直接試験は,手,足,口病(HFMD)を引き起こすエンテロウイルスの詳細な遺伝子型を提供し,他の潜在的ウイルスまたは鑑別された誤診事象を同定した。改良されたコード化オリゴヌクレオチドプライマーベースのNGSアプローチは単純化され,時間節約,費用効果があり,臨床診療におけるウイルス病原体の直接同定に適している。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *病原体 ,  細胞培養 ,  エンテロウイルス ,  *バーコード ,  *ウイルス ,  データ解析 ,  遺伝子型 ,  捕獲 ,  簡素化 ,  *符号化 ,  臨床試験 ,  手足口病
準シソーラス用語： 配列解析 ,  費用対効果 ,  *臨床検体 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 微生物検査  (GC02030H) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (6件)： 臨床検体 ,  ウイルス ,  病原体 ,  同定 ,  バーコード ,  次世代