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J-GLOBAL ID：201702230375062513   整理番号：17A1923768

次世代シークエンシング技術による幹細胞転写制御研究への応用【JST・京大機械翻訳】

The application of next-generation sequencing techniques in studying transcriptional regulation in embryonic stem cells

著者 (4件)： Liu Yajun (東南大学生物科学与医学工程学院生物電子学国家重点実験室,南京,210096) ,  Zhang Feng (東南大学生物科学与医学工程学院生物電子学国家重点実験室,南京,210096) ,  Liu Hongde (東南大学生物科学与医学工程学院生物電子学国家重点実験室,南京,210096) ,  Sun Xiao (東南大学生物科学与医学工程学院生物電子学国家重点実験室,南京,210096)
資料名： Yichuan  (Yichuan)
巻： 39  号： 8  ページ： 717-725  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2546A  ISSN： 0253-9772  CODEN： ICHUDW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 遺伝子転写制御及びそのメカニズムの分析はポストゲノム時代の生物学研究の重点の一つである。ハイスループット配列決定技術の発展により、人々は異なるレベルから遺伝子の転写制御行為を研究し、転写組、転写因子結合、クロマチンの局部構造と全体の空間構造により、転写制御の分子メカニズムを系統的に分析できる。幹細胞分化過程の転写制御の分析は、再生医学の研究と細胞の癌化メカニズムの理解などに重要な意義がある。本論文では、次世代シークエンシング技術による幹細胞転写制御研究における応用について概説した。(1)遺伝子チップまたはRNA配列に基づくトランスクリプトーム解析を行った。(2)染色体の免疫共沈殿(chromatin immunoprecipitation,ChIP)により配列されたエピゲノムと転写因子の結合情報の分析に基づいて、以下の結果を得た。(3)DNase-Seqに基づく染色体の開放性分析を行った。(4)ハイスループット染色質構造捕獲(high-throughput chromosome conformation capture,Hi-C)技術の染色体遠隔相互作用分析に基づいている。遺伝子発現スペクトル、転写因子結合とゲノムの三次元構造などの面から紹介し、いくつかの多能性転写因子(Oct4、Sox2とNanogなど)が幹細胞の乾性と分化における調節作用を維持し、幹細胞の転写制御の研究に参考と参考を提供する。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノム ,  RNA【核酸】 ,  *幹細胞 ,  発癌 ,  クロマチン ,  再生医療 ,  遺伝子発現 ,  立体構造 ,  転写因子
準シソーラス用語： 三次元構造 ,  トランスクリプトーム解析 ,  分子機構 ,  ハイスループット ,  *転写調節 ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： embryonic stem cell ,  transcriptome ,  ChIP ,  DNase-seq ,  Hi-C

分類 (3件)： 薬物学一般  (GV01010J) ,  発生と分化  (EJ16020W) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 次世代シークエンシング ,  幹細胞 ,  転写制御 ,  研究 ,  応用