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J-GLOBAL ID：201702230408965010   整理番号：17A0478455

多重ツールの組合せは遺伝子セット濃縮分析において個々の方法を凌駕する

Combining multiple tools outperforms individual methods in gene set enrichment analyses

著者 (9件)： ALHAMDOOSH Monther (CSL Ltd., VIC, AUS) ,  NG Milica (CSL Ltd., VIC, AUS) ,  WILSON Nicholas J. (CSL Ltd., VIC, AUS) ,  SHERIDAN Julie M. (Walter and Eliza Hall Inst. of Medical Res., VIC, AUS) ,  SHERIDAN Julie M. (Univ. Melbourne, VIC, AUS) ,  HUYNH Huy (CSL Ltd., VIC, AUS) ,  WILSON Michael J. (CSL Ltd., VIC, AUS) ,  RITCHIE Matthew E. (Walter and Eliza Hall Inst. of Medical Res., VIC, AUS) ,  RITCHIE Matthew E. (Univ. Melbourne, VIC, AUS)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 3  ページ： 414-424  発行年： 2017年02月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子セット濃縮分析の集合(EGSEA)は,12のアルゴリズムからの結果を組み合せて最高ランクの遺伝子セットの生物学的関連性を改善する集合遺伝子セットスコアを計算するRNA-seqデータに対し開発された方法である。EGSEAの遺伝子セットデータベースは,16のコレクションからの約25000の遺伝子セットを含む。これは,種々の粒度において遺伝子セットを観察させる多重可視化能力を持つ。EGSEAはシミュレ-ションデータと多くのヒトおよびマウスデータセットにおいて試験され,生物学者のフィードバックに基づいて組み合わされた個々のツールを凌駕した。

シソーラス用語： *組合せ論 ,  *遺伝子 ,  *分析 ,  *アルゴリズム ,  遺伝学実験技術 ,  *ヌクレオチド配列 ,  データ ,  計算 ,  データベース ,  粒度【計算機】 ,  可視化 ,  シミュレーション ,  ヒト ,  マウス
準シソーラス用語： *組合せ解析 ,  *RNA-seq

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  数値計算  (JE02000J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 多重 ,  ツール ,  組合せ ,  遺伝子 ,  濃縮 ,  分析