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J-GLOBAL ID：201702230420932406   整理番号：17A1114730

組織因子経路阻害剤の血しょう中濃度に関連するSNPを検出するための細胞型特異的調節領域の活用【Powered by NICT】

Leveraging cell type specific regulatory regions to detect SNPs associated with tissue factor pathway inhibitor plasma levels

著者 (21件)： Dennis Jessica (Dalla Lana School of Public Health, University of Toronto, Toronto, Canada) ,  Medina-Rivera Alejandra (Program in Genetics and Genome Biology, the Hospital for Sick Children, Toronto, Canada) ,  Medina-Rivera Alejandra (Laboratorio Internacional de Investigacion sobre el Genoma Humano, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Juriquilla, Queretaro, Mexico) ,  Truong Vinh (Dalla Lana School of Public Health, University of Toronto, Toronto, Canada) ,  Antounians Lina (Program in Genetics and Genome Biology, the Hospital for Sick Children, Toronto, Canada) ,  Antounians Lina (Department of Molecular Genetics, University of Toronto, Toronto, Canada) ,  Zwingerman Nora (Dalla Lana School of Public Health, University of Toronto, Toronto, Canada) ,  Carrasco Giovana (Laboratorio Internacional de Investigacion sobre el Genoma Humano, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Juriquilla, Queretaro, Mexico) ,  Strug Lisa (Program in Genetics and Genome Biology, the Hospital for Sick Children, Toronto, Canada) ,  Strug Lisa (Division of Biostatistics, Dalla Lana School of Public Health, University of Toronto, Toronto, Canada) ,  Wells Phil (Ottawa Hospital Research Institute, Ottawa, Canada) ,  Tregoueet David-Alexandre (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, Paris, France) ,  Tregoueet David-Alexandre (INSERM, UMR_S 1166, Paris, France) ,  Tregoueet David-Alexandre (ICAN Institute for Cardiometabolism and Nutrition, Paris, France) ,  Morange Pierre-Emmanuel (INSERM, UMR_S 1062, Marseille, France) ,  Morange Pierre-Emmanuel (Inra, UMR_INRA 1260, Marseille, France) ,  Morange Pierre-Emmanuel (Aix Marseille Universite, Marseille, France) ,  Wilson Michael D. (Program in Genetics and Genome Biology, the Hospital for Sick Children, Toronto, Canada) ,  Wilson Michael D. (Department of Molecular Genetics, University of Toronto, Toronto, Canada) ,  Wilson Michael D. (Heart & Stroke Richard Lewar Centre of Excellence in Cardiovascular Research, Toronto, Canada) ,  Gagnon France (Dalla Lana School of Public Health, University of Toronto, Toronto, Canada)
資料名： Genetic Epidemiology  (Genetic Epidemiology)
巻： 41  号： 5  ページ： 455-466  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2580A  ISSN： 0741-0395  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 組織因子経路阻害因子(TFPI)は血管内血栓の形成,虚血性心疾患,虚血性脳卒中,および静脈血栓塞栓症(VTE)として臨床的に発現を調節する。TFPIプラズマレベルは遺伝性ではあるが,TFPI血漿レベル変動の基礎となる遺伝学は十分に理解されていない。TFPI血漿レベルの最初のゲノムワイド関連スキャン(GWAS),VTEの確認五拡張フランス系カナダ人家族から251人で実施を報告した。発見を改善するために,著者らはまた(1)止血経路遺伝子,および(2)血管内皮細胞(EC)調節領域,TFPIの最高expresserであるにおける一塩基多型(SNP)を優先順位付けする仮説(HD)GWASアプローチを適用した。GWASは会合の示唆的証拠(P値<5×10~ 8)と131のSNPを同定したが,SNPは統計的有意性のゲノムワイドしきい値に達しなかった。止血経路遺伝子は,TFPI血漿レベル関連するSNP(グローバル仮説検定P値=0.147)のための濃縮されなかったが,EC調節領域は偶然(グローバル仮説検定P値=0.046)で予想した以上にTFPI血漿レベル関連するSNPを含んでいた。それ故に著者らは,ゲノム-ワイドのSPNsを成層,成層偽発見率(sFDR)制御を介してEC調節領域を優先順位付け,q値によるSNPをreranked。最小q値は0.27で,トップランクのSNPは1,033名の非血縁VTE例のMARTHA複製試料における会合の証拠を示さなかった。本研究はTFPIのための新しい遺伝子座にはならなかったが,本研究は,将来のGWAS研究のための優先順位付け方式におけるエピゲノムデータを利用する戦略を明らかにした。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝 ,  仮説検定 ,  フランス共和国 ,  冠動脈疾患 ,  *トロンボプラスチン ,  血管内皮細胞 ,  ゲノム ,  一塩基多型 ,  走査 ,  血管 ,  止血 ,  *血漿中濃度 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  血栓症
準シソーラス用語： 静脈血栓塞栓症 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： エピジェネティクス ,  遺伝的関連研究 ,  多重仮説の試験 ,  thrombosis ,  組織因子経路阻害剤

分類 (1件)： 循環系の疾患  (GJ03000C)

タイトルに関連する用語 (8件)： 組織因子 ,  経路 ,  阻害剤 ,  血しょう中濃度 ,  SNP ,  細胞型 ,  調節領域 ,  活用