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J-GLOBAL ID：201702230677683003   整理番号：17A0986288

compMS2Miner:高分解能LC-MSデータセットのための自動化可能な代謝産物同定,可視化ならびにデータ共有Rパッケージ

compMS2Miner: An Automatable Metabolite Identification, Visualization, and Data-Sharing R Package for High-Resolution LC-MS Data Sets

著者 (7件)： EDMANDS William M. B. (UC Berkeley, California, USA) ,  PETRICK Lauren (UC Berkeley, California, USA) ,  BARUPAL Dinesh K. (Univ. California Davis, California, USA) ,  SCALBERT Augustin (International Agency for Res. on Cancer (IARC), Lyon, FRA) ,  WILSON Mark J. (Tulane Univ., Louisiana, USA) ,  WICKLIFFE Jeffrey K. (Tulane Univ., Louisiana, USA) ,  RAPPAPORT Stephen M. (UC Berkeley, California, USA)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 89  号： 7  ページ： 3919-3928  発行年： 2017年04月04日 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 高分解能LC-MSデータの包括的代謝産物アノテーションワークフローとして,オープンソースMScompMS2Minerプログラムパッケージを開発した。MScompMS2Minerの食餌性肥満マウスおよび非肥満マウスの血清試料に関する研究への応用事例を紹介した。複合スペクトルは北米MassBankリポジトリと極めて良く一致した。

シソーラス用語： 集合 ,  LC-MS分析 ,  *代謝産物 ,  *HPLC-MS分析 ,  *プログラムパッケージ ,  ソフトウェア ,  データ処理 ,  マウス ,  リポジトリ ,  アノテーション
準シソーラス用語： データセット ,  *compMS2Miner ,  オープンソースソフトウェア

分類 (4件)： 数値計算  (JE02000J) ,  質量分析  (CC03013N) ,  動物の代謝と栄養一般  (EJ02031R) ,  生物物理的研究法  (EA03020V)

タイトルに関連する用語 (9件)： 高分解能 ,  LC-MS ,  データセット ,  自動化 ,  代謝産物 ,  同定 ,  可視化 ,  データ共有 ,  Rパッケージ