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J-GLOBAL ID：201702231385307873   整理番号：17A1518943

四川省におけるアヒルのmtDNAの全配列のクローニングと生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Complete Sequence Cloning and Bioinformatics Analysis of Sichuan Sheldrake Duck Mitochondrial Genome

著者 (8件)： Xie Aixuan (四川農業大学動物科技学院,成都,611130) ,  Wu Qichao (四川農業大学動物科技学院,成都,611130) ,  Li Side (四川農業大学動物科技学院,成都,611130) ,  Luo Jun (四川農業大学動物科技学院,成都,611130) ,  Zhang Tao (四川農業大学動物科技学院,成都,611130) ,  Liu Hehe (四川農業大学動物科技学院,成都,611130) ,  Zhang Jun (四川農業大学動物科技学院,成都,611130) ,  He Hua (四川農業大学動物科技学院,成都,611130)
資料名： Xumu Shouyi Xuebao  (Xumu Shouyi Xuebao)
巻： 48  号： 3  ページ： 436-445  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2231A  ISSN： 0366-6964  CODEN： CMHPAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究の目的は、四川省のアヒルのミトコンドリアDNAゲノム全配列(mtDNA)を獲得し、この遺伝資源の保護と利用に参考を提供することである。近縁種のミトコンドリアゲノム配列を研究し、Primer 6.0を用いて16対のプライマーを設計し、PCRクローニングシークエンシング技術を用いて四川省のアヒルのmtDNAゲノム配列を獲得した。結果は,mtDNAの全長が16604bpであり,塩基配列がA(29.19%),C(32.82%),G(15.79%),T(22.20%)であることを示した。それらは,22のtRNA遺伝子,2つのrRNA遺伝子,13の蛋白質コード化遺伝子,および1つの非コード領域(D-loop領域)を含んでいた。オンラインソフトウェアtRNAscan-SE1.21とRNA structure5.6を用いて、22個のtRNA遺伝子は標準の4つの一定のアームの三葉草の二次構造であることが分かった。四川省におけるアヒルのmtDNAゲノムのD-loop領域の配列分析により、Poly(c)、TAS、E-box、F-box、D-box、Bird-similarity box及びCXB1の保存ボックスが含まれていることが分かった。MEGA6.0を用いて、N-J法を用いて、ミトコンドリアD-loop区と全配列に基づき、進化樹を行い、四川省のアヒルとアヒルの血縁関係が最も近いことを発見した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  RNA【核酸】 ,  ヌクレオチド配列 ,  *アヒル ,  二次構造 ,  rRNA遺伝子 ,  ゲノム ,  ミトコンドリア
準シソーラス用語： D-loop領域 ,  tRNA遺伝子 ,  ゲノム配列 ,  *バイオインフォマティクス ,  *クローニング ,  *ミトコンドリアDNA ,  *四川省 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： mitochondrial genome ,  Sichuan Sheldrake duck ,  genetic evolution

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  魚類  (FH02020K)

タイトルに関連する用語 (6件)： 四川省 ,  アヒル ,  mtDNA ,  クローニング ,  生物情報学 ,  解析