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J-GLOBAL ID:201702231646328838   整理番号:17A0134392

ナノポアセンシング手法による一本鎖DNA中の8-オキソ-2’-デオキシグアノシンの選択的検出

Selective Detection of 8-Oxo-2′-deoxyguanosine in Single-Stranded DNA via Nanopore Sensing Approach
著者 (8件):
資料名:
巻: 88  号:ページ: 1073-1077  発行年: 2016年01月19日 
JST資料番号: A0395A  ISSN: 0003-2700  CODEN: ANCHAM  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 短報  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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グアニンの酸化の間に生じる8-オキソ-7,8-ジヒドロ-2’-デオキシグアノシン(8-oxoGまたはOG)は,酸化的損傷から生じる最も一般的な病変の1つである。8-oxoGは,複製エラー(G:C対A:T)および転写干渉を引き起こして遺伝毒性を誘発する。以前の研究で,8-oxoGの細胞内レベルが疾患および老化に関連しており,細胞における酸化的損傷のバイオマーカーとして8-oxoGを使用できることが示された。最近,著者らは,α-溶血素(αHL)ナノポアを介してフェロセン⊂ククルビト[7]ウリル(Fc⊂CB[7])錯体で修飾した一本鎖DNA(ssDNA)の転位はホスト-ゲスト錯体を解放し,非常に特徴的な現在の痕跡を生成することを示した。この知見は,ssDNA中のタンパク質,小分子および5-メチルシトシンの検出に首尾よく適用されている。本研究では,αhLを介したAd⊂CB[7]修飾DNAを通して生成した特徴的な電流事象の記録によるssDNA中の8-oxoGの検出法を開発した。ssDNA中の8-oxoGが,アダマンタン・クルクビット[7]ウリル(Ad⊂CB7)錯体を用いた8-oxoGの選択的修飾と組み合わせて,aHLナノポアセンサーを用いて確実に検出できることを示した。8-oxoG部位の選択的かつ効率的な改変が,検出を成功させるための鍵である。最初に1,12-ドデカンジアミンを8-オキソG含有DNA分子と高収率でカップリングさせ,次にアミド形成反応によってAd部分を未反応アミンに結合させた。CB[7]とインキュベーション後,ホスト-ゲスト錯体修飾DNAハイブリッドはαHLを介して転位させた。特徴的な事象が記録され,DNA混合物中のOG-DNA含有量を定量できた。既存の方法と比較して,本法は,単一分子レベルでのssDNA中の8-オキソG部位の検出のための,特に大量試料のハイスループットスクリーニングに適し,信頼性があり,迅速で低コストのアプローチを提供する。
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分類 (2件):
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バイオアッセイ  ,  核酸一般 
物質索引 (5件):
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