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J-GLOBAL ID：201702232214873985   整理番号：17A1825738

広範なゲノム不均一性栽培ジャガイモにおける優先的対立遺伝子発現とコピー数依存型の発現を誘導する【Powered by NICT】

Extensive genome heterogeneity leads to preferential allele expression and copy number-dependent expression in cultivated potato

著者 (6件)： Pham Gina M. (Department of Plant Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan, 48824-1312, USA) ,  Newton Linsey (Department of Plant Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan, 48824-1312, USA) ,  Wiegert-Rininger Krystle (Department of Plant Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan, 48824-1312, USA) ,  Vaillancourt Brieanne (Department of Plant Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan, 48824-1312, USA) ,  Douches David S. (Department of Plant, Soil and Microbial Sciences, Michigan State University, East Lansing, Michigan, 48824-1312, USA) ,  Buell C. Robin (Department of Plant Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan, 48824-1312, USA)
資料名： Plant Journal  (Plant Journal)
巻： 92  号： 4  ページ： 624-637  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1374A  ISSN： 0960-7412  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ホモ接合二倍体に比較して,倍数体における多重同族体またはhomeologsの存在はゲノム進化に影響を与えることができる変異に大きな耐性を与えた。本研究では,栽培ジャガイモ(Solanum tuberosumL.)の六系統のゲノムにおける配列と構造変化,栄養繁殖同質四倍体およびトランスクリプトームに及ぼすそれらの影響を記述した。配列多様性は高レベルの対立遺伝子多様性のを示唆する約1当たり50塩基の平均一塩基多型(SNP)速度で高かった。付加遺伝子発現は葉と塊茎トランスクリプトームにおける2180と3502および3367と5270の間で遺伝子の優先的な対立遺伝子発現を対照葉(3605遺伝子)および塊茎(6156遺伝子)に,それぞれ観察された。優先対立遺伝子発現は進化的に保存された遺伝子育種選抜過程で被子植物に共通の生物学的過程に関与する遺伝子の特異的対立遺伝子の選択を示唆すると有意に関連した。コピー数多型は,重複あるいは欠失を示す各品種における16098~18921遺伝子と激しいであった。コピー数可変遺伝子は進化的に最近,少ししか発現していない,および生物的および非生物的ストレス処理適応における役割の示唆に応答して発現増加を示す遺伝子の濃縮傾向があった。遺伝子発現に及ぼす遺伝子コピー数の影響はコピー数と遺伝子発現の間の相関を持つ528遺伝子を検出した。まとめるとこれらのデータは,コード配列の対立遺伝子変異に加えて,四倍体ジャガイモゲノムの不均一性は,対立遺伝子選択とコピー数依存発現効果の影響を受けた高度に動的なトランスクリプトームに寄与することを示唆する。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *ジャガイモ ,  塊茎 ,  二倍体 ,  *遺伝子 ,  *ゲノム ,  一塩基多型 ,  *不均一性 ,  四倍体 ,  *遺伝子発現 ,  *コピー数 ,  *対立遺伝子 ,  トランスクリプトーム ,  *栽培 ,  品種 ,  育種

著者キーワード (5件)： コピー数多型 ,  優先対立遺伝子発現 ,  遺伝子発現 ,  Solanum tuberosum(ジャガイモ) ,  遺伝的変異

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (10件)： ゲノム ,  不均一性 ,  栽培 ,  ジャガイモ ,  優先 ,  遺伝子発現 ,  コピー数 ,  依存型 ,  発現 ,  誘導