文献

J-GLOBAL ID：201702232237138647   整理番号：17A2008098

小RNAome配列決定はプラナリアSchmidtea mediterraneaにおける多能性成体幹細胞の低分子RNA景観を明らかにする【Powered by NICT】

Small RNAome sequencing delineates the small RNA landscape of pluripotent adult stem cells in the planarian Schmidtea mediterranea

著者 (10件)： Li Yue (Key Laboratory of Stem Cell Biology, Institute of Health Sciences, Shanghai Institute for Biological Science, Shanghai Jiao-Tong University School of Medicine and Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China) ,  Li Yue (Department of Cardiology, Changhai Hospital, Shanghai 200433, China) ,  Li Yue (Center for Systems Biology, Soochow University, Suzhou 215006, China) ,  Zeng An (Key Laboratory of Stem Cell Biology, Institute of Health Sciences, Shanghai Institute for Biological Science, Shanghai Jiao-Tong University School of Medicine and Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China) ,  Han Xiao-Shuan (Key Laboratory of Stem Cell Biology, Institute of Health Sciences, Shanghai Institute for Biological Science, Shanghai Jiao-Tong University School of Medicine and Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China) ,  Li Ge (Key Laboratory of Stem Cell Biology, Institute of Health Sciences, Shanghai Institute for Biological Science, Shanghai Jiao-Tong University School of Medicine and Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China) ,  Li Yong-Qin (Key Laboratory of Stem Cell Biology, Institute of Health Sciences, Shanghai Institute for Biological Science, Shanghai Jiao-Tong University School of Medicine and Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China) ,  Shen Bairong (Center for Systems Biology, Soochow University, Suzhou 215006, China) ,  Jing Qing (Key Laboratory of Stem Cell Biology, Institute of Health Sciences, Shanghai Institute for Biological Science, Shanghai Jiao-Tong University School of Medicine and Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China) ,  Jing Qing (Department of Cardiology, Changhai Hospital, Shanghai 200433, China)
資料名： Genomics Data  (Genomics Data)
巻： 14  ページ： 114-125  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2966A  ISSN： 2213-5960  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 小非コードRNAは遺伝子発現の調節に重要な役割を果たし,動物発生の重要な調節因子である。淡水プラナリアは,欠落した身体部の再生,幹細胞調節と組織再生の根底にある機構を研究するための新たなモデルを表現するための驚くべき能力を示した。ここでは,プラナリア成体幹細胞で発現され,組織再生に関与する小RNAを同定するために次世代シーケンシング(NGS)を利用した。サイズ1830ntからマイクロRNA(miRNA),piwi相互作用RNA(piRNA),小rDNA由来RNA(srRNAs)と内因性低分子干渉RNA(endo-siRNA)個体群をプロファイリングし,244個の保存されたmiRNAの発現を測定し,41種類の新しいmiRNAと64種の新規endo-siRNAを同定した。発現プロファイリング解析は最もpiRNAとsrRNAsが再生の間にアップレギュレートされることを,最も豊富に発現srRNAsは5.8Sと28S rRNAからのものであることを明らかにした。標的予測法は低分子RNAとm RNA発現の逆相関を調べるために採用した。が動的に変化する小RNAにより標的とされる遺伝子に基づく遺伝子調節ネットワークを構築した。これらの結果は,プラナリアで知られている低分子RNAレパートリーを拡大し,貴重な洞察と幹細胞再生における低分子RNA景観を理解するための豊富な資源を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  相互作用 ,  mRNA ,  siRNA ,  遺伝子発現 ,  *プラナリア ,  *幹細胞 ,  遺伝子 ,  個体群
準シソーラス用語： プロファイリング ,  piRNA ,  マイクロRNA ,  組織再生 ,  *低分子RNA ,  *成体幹細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  核酸一般  (EB04010U) ,  生殖器官  (EJ15020P)

タイトルに関連する用語 (5件)： プラナリア ,  多能性 ,  成体幹細胞 ,  低分子RNA ,  景観