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J-GLOBAL ID：201702232243357694   整理番号：17A1518940

MC4R遺伝子サイレンシングによるウシ線維芽細胞内遺伝子発現への影響【JST・京大機械翻訳】

Effects of MC4R Gene Silencing on Gene Expression in Bovine Fibroblast Cells

著者 (9件)： Huang Meng (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Xian Ming (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Shi Mingyan (洛陽師范学院生命科学学院,洛陽,471022) ,  Chen Yan (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Zhang Lupei (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Gao Huijiang (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Li Junya (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Xu Shangzhong (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Gao Xue (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193)
資料名： Xumu Shouyi Xuebao  (Xumu Shouyi Xuebao)
巻： 48  号： 3  ページ： 403-415  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2231A  ISSN： 0366-6964  CODEN： CMHPAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,ウシの線維芽細胞におけるエネルギー代謝と脂肪代謝関連経路における遺伝子発現に及ぼすメラノサイト4受容体遺伝子(MC4R)サイレンシングの影響を研究することである。さらに,MC4R遺伝子と肉牛の枝肉品質及びエネルギーバランスと脂肪代謝の間の関係を明らかにした。本実験では、MC4Rによりノックダウンされたウシ線維芽細胞系を使用し、深さシークエンシング技術により、実験群(MC4Rノックダウン)と陰性対照群(MC4R未ノックダウン)における発現量の差異が顕著な遺伝子を探索した。エネルギー代謝,脂肪輸送,および関連する調節経路を含む異なる遺伝子について,GOアノテーションクラスタ分析とKEGG経路濃縮分析により,深く濃縮された分析が行われた。異なる発現遺伝子の10個の遺伝子をランダムに選択し、リアルタイム定量PCRを用いて、深さの配列決定結果を検証した。また、本研究では、ウシSNPチップを用いて、上述の標的遺伝子の一塩基多型(SNP)を検出し、136頭のシメンタール牛に対して、標的遺伝子の各SNPに基づく遺伝子型検出を行った。各SNPの分類データに基づき、本研究はさらにPLINKソフトウェアを用いて、SNPと牛の各枝肉の性状との関連性について分析を行った。深さ配列決定により、2組の陽性MC4Rがノックダウンされたウシ線維芽細胞系において、799個の差異発現遺伝子が発見され、その中に遺伝子が1703個、遺伝子が6096個下方制御された。有意なGO分類は,2つの群の間で,エネルギー代謝調節と脂肪輸送過程に関連する265の遺伝子を選択し,機能的クラスター分析は,エネルギー代謝に関連する遺伝子の29の遺伝子をスクリーニングし,KEGG経路を分析することによって発見された。エネルギー代謝、脂肪輸送などの過程に関連する265個の差異発現遺伝子は全部で40個の異なる経路に関与している。MC4R遺伝子とエネルギー代謝の調節に密接に関連するLeptin、AGRP、NPYとPOMCなどの遺伝子はアディポネクチンシグナル経路に属し、MC4Rノックダウンはこの経路における22個の遺伝子の発現を著しく変化させた。リアルタイムPCRの結果は,以下のことを示した。選択した10の遺伝子(発現量の増加遺伝子:CFB、RSAD2、IFIT3、CHI3L1とBOLA-N;発現量のダウンレギュレーション遺伝子:UPK1B、IER2、LASS3、TGFβ3とAXUD1)のmRNA発現レベルは配列決定結果と有意差がなかった。その結果,深さ配列決定データの正確さと再現性が確認された。さらに、50Kの密度の牛SNPチップを用いて、本研究では、16個のSNPs遺伝子座を発見し、合計11個の標的遺伝子に関連し、SNPsと牛の各枝肉の性状との関連分析結果を示した。10番染色体におけるTGFβ3は,ウシの眼筋の面積,体重,腰部肉厚,大腿肉厚および外リッジに有意な影響を及ぼし(P<0.05),眼の重さおよびリリッジ重に有意な影響を及ぼした(P<0.01)。10番染色体に位置するRHOJ遺伝子は,シソ牛の眼筋面積に有意な影響を及ぼし(P<0.05),19番染色体上のKRT17遺伝子と7番染色体上のVCAN遺伝子は有意に影響し(P<0.01,P<0.05),1番染色体におけるMASP1遺伝子は肉色に有意な影響を与えた(P<0.05)。結果は,MC4R遺伝子サイレンシングがウシの線維芽細胞におけるエネルギー代謝,脂肪代謝およびエネルギーホメオスタシスに関連する遺伝子の発現を有意に影響し,MC4R遺伝子が肉牛のエネルギーバランスと脂肪代謝を調節し,肉の品質に影響を与えることを示した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子発現 ,  一塩基多型 ,  *遺伝子 ,  ダウンレギュレーション ,  エネルギー代謝 ,  遺伝子型 ,  肉牛 ,  品質 ,  脂質代謝 ,  ソフトウェア ,  染色体 ,  *線維芽細胞 ,  体重 ,  リアルタイムPCR法
準シソーラス用語： 標的遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： MC4R gene ,  gene knockdown ,  mRNA expression ,  correlation analysis

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (4件)： サイレンシング ,  ウシ ,  線維芽細胞 ,  遺伝子発現