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J-GLOBAL ID：201702232327793198   整理番号：17A1099329

ヒト常在菌叢ゲノムにおける機能的シフトの分類学的ドライバの系統的特性化と解析【Powered by NICT】

Systematic Characterization and Analysis of the Taxonomic Drivers of Functional Shifts in the Human Microbiome

著者 (4件)： Manor Ohad (Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle, WA 98195, USA) ,  Borenstein Elhanan (Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle, WA 98195, USA) ,  Borenstein Elhanan (Department of Computer Science and Engineering, University of Washington, Seattle, WA 98195, USA) ,  Borenstein Elhanan (Santa Fe Institute, Santa Fe, NM 87501, USA)
資料名： Cell Host & Microbe  (Cell Host & Microbe)
巻： 21  号： 2  ページ： 254-267  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2784A  ISSN： 1931-3128  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト常在菌叢ゲノムの比較分析は,多くの疾患と関連していることを分類学的および機能的の両方でのシフトを同定した。今日まで,しかし,ミクロビオーム分類と機能はほとんど独立に研究され,機能的不均衡の分類学的運転者を系統的に同定されていない。FishTaco,疾患関連機能的シフトへの分類群レベルの寄与を正確に定量するための分類学的および機能的比較解析統合する解析的および計算フレームワークを提案した。いくつかの大規模メタゲノムコホートにFishTacoを適用して,著者らは,ミクロビオームの機能的能力の変化は,特定の分類群にさかのぼることができることを示した。さらに,機能的シフトとその寄与レベルを駆動する1組の分類群を機能間で著しく変化した。は,異なる疾患における類似した機能的不均衡が疾患特異的および共有両分類群によって駆動されることを見出した。ミクロビオーム生態学的及び機能的動力学のそのような統合解析は,将来の常在菌叢ゲノムベース治療を知らせる,常在菌叢ゲノムの機能的能力を操作するための推定介入標的を特定することができる。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 治療法 ,  *キャラクタリゼーション ,  *ヒト ,  微生物 ,  生態学
準シソーラス用語： 統合解析 ,  機能的能力 ,  分類群 ,  不均衡 ,  比較分析 ,  *分類学 ,  *常在菌叢ゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： ヒト常在菌叢ゲノム ,  機能性メタゲノミクス ,  分類学的プロファイリング ,  組成シフト ,  比較分析 ,  微生物ドライバ ,  マルチオミックス ,  統合解析

分類 (2件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C)

タイトルに関連する用語 (8件)： ヒト ,  常在菌 ,  ゲノム ,  シフト ,  ドライバ ,  系統 ,  特性化 ,  解析