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J-GLOBAL ID：201702232428629308   整理番号：17A1742736

リウマチ性関節炎患者における滑膜線維芽細胞遺伝子発現の公共データ解析【JST・京大機械翻訳】

Whole-genome expression analysis of synovial fibroblasts in rheumatoid arthritis

著者 (3件)： Liu Ke (河南省人民医院骨科,鄭州,450003) ,  Hou Yi (河南省人民医院骨科,鄭州,450003) ,  Zheng Jia (河南省人民医院骨科,鄭州,450003)
資料名： Zhonghua Guke Zazhi  (Zhonghua Guke Zazhi)
巻： 37  号： 11  ページ： 691-697  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2309A  ISSN： 0253-2352  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:リウマチ性関節炎の発生、進行過程における膝関節滑膜線維芽細胞の作用及び発病過程において重要な作用を発揮する経路を検討すること。..・・・・・・・.により、関節リウマチの発生と進行過程における重要な役割を検討する。方法:公開データベースNCBI GEOとEBI ArrayExpressにおいて、キーワードを検索することによりデータ検索を行い、要求に合致する全ゲノム発現スペクトルチップデータをスクリーニングした。収集したmRNAチップの発現スペクトルデータに対して整合を行い、GeneSpringソフトを用いてデータの正規化を行い、SAM方法により差異発現遺伝子と差異発現倍数を確定した。オンラインツールDAVIDとSTRINGを用いて、差異発現遺伝子に対して機能の富化と相互作用分析を行った。結果:データ検索により、要求に合った公共データセット2個を発見し、患者と健常人群の膝関節滑膜線維芽細胞の発現スペクトルを比較した後、顕著な差異発現遺伝子336個を同定し、その中で患者群は顕著に下方制御された遺伝子が261個、顕著に上方制御された遺伝子が75個であった。細胞外マトリックスのコード遺伝子はすべての顕著な下方制御遺伝子の13.6%を占めた。透明な軟骨の重要な成分はCOL9A3であり、基底膜を構成するCOL4A5、およびWNT遺伝子ファミリーメンバーWNT2、WNT11、WNT16はいずれもある程度の発現低下がある。II型コラーゲンを分解できるマトリックスメタロプロテアーゼ13(matrix metalloproteinase 13、MMP13)の発現量は著しく上昇し、それは直接に軟骨組織の分解に参与し、また他の蛋白と相互作用して細胞の生長を調節することができる。結論:公共データのマイニングを通じて、細胞外マトリックスの分解がリウマチ関節炎の病状発展における重要な作用を明らかにした。MMP13、WNT2、WNT 11、WNT16、COL9A3、COL4A5は細胞外基質、軟骨関節の合成、分解に関連する遺伝子はリウマチ性関節炎治療の標的になる可能性がある。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子発現 ,  ダウンレギュレーション ,  タンパク質 ,  ゲノム ,  *患者 ,  治療法 ,  mRNA ,  膝関節 ,  相互作用 ,  *遺伝子 ,  *関節リウマチ ,  *リウマチ ,  軟骨 ,  細胞外マトリックス
準シソーラス用語： *滑膜線維芽細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Arthritis ,  rheumatoid ,  Knee joint ,  Synovial Membrane ,  Fibroblasts ,  Gene expression profiling

分類 (1件)： 運動器系の疾患  (GG03000T)

タイトルに関連する用語 (5件)： リウマチ性関節炎 ,  患者 ,  滑膜線維芽細胞 ,  遺伝子発現 ,  データ解析