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J-GLOBAL ID：201702233142262708   整理番号：17A1022812

Mdmxのヌトリンクラス阻害剤の仮想スクリーニングのためのドッキング/分子動力学プロトコルの性能【Powered by NICT】

Performance of a docking/molecular dynamics protocol for virtual screening of nutlin-class inhibitors of Mdmx

著者 (7件)： Bharatham Nagakumar (Department of Structural Biology, St. Jude Children’s Research Hospital, 262 Danny Thomas Place, Memphis, TN 38105, USA) ,  Finch Kristin E. (Department of Developmental Neurobiology, St. Jude Children’s Research Hospital, 262 Danny Thomas Place, Memphis, TN 38105, USA) ,  Min Jaeki (Department of Chemical Biology and Therapeutics, St. Jude Children’s Research Hospital, 262 Danny Thomas Place, Memphis, TN 38105, USA) ,  Mayasundari Anand (Department of Chemical Biology and Therapeutics, St. Jude Children’s Research Hospital, 262 Danny Thomas Place, Memphis, TN 38105, USA) ,  Dyer Michael A. (Department of Developmental Neurobiology, St. Jude Children’s Research Hospital, 262 Danny Thomas Place, Memphis, TN 38105, USA) ,  Guy R. Kiplin (Department of Chemical Biology and Therapeutics, St. Jude Children’s Research Hospital, 262 Danny Thomas Place, Memphis, TN 38105, USA) ,  Bashford Donald (Department of Structural Biology, St. Jude Children’s Research Hospital, 262 Danny Thomas Place, Memphis, TN 38105, USA)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 74  ページ： 54-60  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ドッキング及び分子動力学を含む仮想スクリーニングプロトコルは,p53とMdmx間の相互作用,ある種の癌のドライバーとしての同定された相互作用の阻害のためのヌトリンクラスの一連の化合物の効力を試験する蛍光偏光アッセイの結果に対して試験した。プロトコルは,AutoDockスコア(ADscore)に基づくカットオフを持つ標準ドッキング法(AutoDock)であり,続いてドッキング姿勢からの根平均二乗偏差(RMSD)に基づくカットオフを用いた分子動力学シミュレーションを用いた。実験および計算結果の解析を,ADscore単独の中程度の性能が,劇的にRMSDも使用すると改善された性能を示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 計算機シミュレーション ,  相互作用 ,  *分子動力学 ,  *プロトコル ,  p53タンパク質 ,  *ドッキング
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  スコア ,  AutoDock ,  蛍光偏光 ,  *バーチャルスクリーニング ,  *阻害剤 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  蛍光偏光 ,  仮想スクリーニング ,  Mdmx ,  Mdm4 ,  ヌトリン

分類 (2件)： 薬物の相互作用  (GV01070X) ,  薬物の研究法  (GV01020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： MDMX ,  阻害剤 ,  仮想スクリーニング ,  ドッキング ,  分子動力学 ,  プロトコル