文献

J-GLOBAL ID：201702233518591221   整理番号：17A1790038

茶におけるNAC転写因子ファミリーの同定および生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Identification and Bioinformatics Analysis of NAC Transcription Factor Family in Tea Tree (Camellia sinensis L.)

著者 (6件)： Han Yapeng (信陽師范学院生命科学学院,河南信陽,464000) ,  Cheng Lin (信陽師范学院生命科学学院,河南信陽464000;大別山農業生物資源保護与利用研究院,河南信陽464000) ,  Yang Lingxiao (信陽師范学院生命科学学院,河南信陽,464000) ,  Wang Xiangnan (信陽師范学院生命科学学院,河南信陽,464000) ,  Zhang Yuanyuan (信陽師范学院生命科学学院,河南信陽,464000) ,  Wang Lei (信陽師范学院生命科学学院,河南信陽464000;大別山農業生物資源保護与利用研究院,河南信陽464000)
資料名： Henan Daxue Xuebao. Ziran Kexue Ban  (Henan Daxue Xuebao. Ziran Kexue Ban)
巻： 47  号： 3  ページ： 301-309  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1496A  ISSN： 1003-4978  CODEN： HZKEEE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 生物情報学の手段を用いて、茶樹のNAC転写因子ファミリーのメンバー、システムの発育、コードタンパク質の物理化学的性質と構造及び創傷ストレス処理後の発現について分析した。研究結果によると、茶樹NAC転写因子ファミリーは49個のメンバーを含み、シロイヌナズナの106個のNACメンバーと系統発生系統樹を構築し、結果により、茶樹はシロイヌナズナNACファミリー17個の亜族の10番目と14番目のサブファミリーを欠いていることが示された。物理化学的性質と構造分析により、茶樹のNACタンパク質のほとんどは親水性アミノ酸であり、二次構造は規則的なコイルを主とし、三次構造はほとんど類似していることが分かった。保存モチーフの分析により、茶樹のNACメンバーは7つの保存モチーフを含み、そのうちモチーフ3、4、2と5、1はそれぞれNACドメインのA、B、CとDサブドメインを代表し、モチーフ7はサブドメインEであることを示した。第15、16と17族の大部分のメンバーは第2と第4の2つの保存モチーフを欠失し、第15族のメンバーは特異的な保存モチーフを持つ。6番目のメンバーは6番目の保存モチーフを持っていることが明らかになった6. 6番目のメンバーは6番目に保存されている。機械的創傷処理条件下での発現パターン分析により、第11族のCsNAC33とCsNAC34の二つのメンバーは異なるタンパク質ドメインを構成するが、創傷処理に対応する時に相対的に一致する発現パターンを呈することが分かった。一方、16族のCsNAC47とCsNAC48の二つのメンバーは一致するタンパク質ドメインを構成しているが、その発現パターンは分化している。これらの結果は,茶のNAC遺伝子ファミリーの機能を研究するための理論的基礎を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 系統樹 ,  構造解析 ,  *タンパク質 ,  アミノ酸 ,  三次構造 ,  親水性 ,  系統発生 ,  二次構造 ,  Arabidopsis thaliana
準シソーラス用語： 遺伝子ファミリー ,  タンパク質ドメイン ,  遺伝子発現パターン ,  物理化学的性質 ,  *バイオインフォマティクス ,  *NAC転写因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Camellia sinensis ,  NAC transcription factors ,  phylogeny ,  functional divergence

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 茶 ,  NAC転写因子 ,  ファミリー ,  同定 ,  生物情報学 ,  解析