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J-GLOBAL ID：201702233697914106   整理番号：17A1552195

結合モジュールと調整可能なゲノム背景用語によるヒト系統特異的転写共調節因子Enabledの同定【Powered by NICT】

Identification of Human Lineage-Specific Transcriptional Coregulators Enabled by a Glossary of Binding Modules and Tunable Genomic Backgrounds

著者 (10件)： Mariani Luca (Division of Genetics, Department of Medicine, Brigham and Women’s Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Weinand Kathryn (Division of Genetics, Department of Medicine, Brigham and Women’s Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Vedenko Anastasia (Division of Genetics, Department of Medicine, Brigham and Women’s Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Barrera Luis A. (Division of Genetics, Department of Medicine, Brigham and Women’s Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Barrera Luis A. (Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology (HST), Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Barrera Luis A. (Committee on Higher Degrees in Biophysics, Harvard University, Cambridge, MA 02138, USA) ,  Bulyk Martha L. (Division of Genetics, Department of Medicine, Brigham and Women’s Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Bulyk Martha L. (Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology (HST), Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Bulyk Martha L. (Committee on Higher Degrees in Biophysics, Harvard University, Cambridge, MA 02138, USA) ,  Bulyk Martha L. (Department of Pathology, Brigham and Women’s Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 5  号： 3  ページ： 187-201.e7  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転写因子(TF)は,遺伝子発現を調節する特異的DNAモチーフに結合することにより細胞過程を制御する。調節領域のモチーフ濃縮分析は,直接的および間接的なTF結合部位を同定することができる。,公的に利用可能な,新しい普遍的な蛋白質結合マイクロアレイデータから671後生動物TFのための共有特異性の108の非冗長TF8mer「モジュール」の用語集を作成した。239ENCODE TFクロマチン免疫沈降シーケンシングデータセットとそれに関連したRNA配列決定プロファイルの解析は,8merモジュールである間接結合モチーフとそれに関連する係留TFを同定における位置重み行列よりもより正確な示唆した。ジャンル(ゲノム等価負領域),調節領域の解析のための整合ゲノム背景配列の構築のための調整可能なツールを開発した。ジャンルはバックグラウンド配列構築への四種類の最先端レベル手法より優れていた。連結因子の共起の間接結合モチーフの解析にこのTF8mer用語集とジャンルを用い,新しいTF相互作用を示唆した。はこれらのツールは組織特異的遺伝子調節プログラムを明らかにする助けとなるであろうことを予測した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 係留 ,  結合部位 ,  転写因子 ,  タンパク質結合 ,  *ゲノム ,  遺伝子発現 ,  DNAマイクロアレイ ,  *ヒト ,  RNA【核酸】 ,  DNA【核酸】 ,  遺伝的調節
準シソーラス用語： クロマチン免疫沈降反応 ,  特異性 ,  後生動物 ,  *調節因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 転写因子 ,  DNA結合特異性 ,  モチーフ濃縮 ,  ChIP-seq解析 ,  背景構築 ,  ENCODE

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (9件)： モジュール ,  ゲノム ,  背景 ,  用語 ,  ヒト ,  系統 ,  転写 ,  調節因子 ,  同定