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J-GLOBAL ID:201702234004016298   整理番号:17A1510918

in silico分析のBRCA1/2ミスセンス変異と価値【Powered by NICT】

BRCA1/2 missense mutations and the value of in-silico analyses
著者 (30件):
資料名:
巻: 60  号: 11  ページ: 572-577  発行年: 2017年 
JST資料番号: A1224A  ISSN: 1769-7212  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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健康および罹患者におけるBRCA1/2の遺伝的変異の臨床的意義がある。が,変異体解釈はミスセンス変異体にとって特に挑戦的である。それらの大部分は知られていない臨床的意義(VUS)の変異体として分類される。計算(in silico)予測プログラムがアクセスする容易であるが,VUSを分類するための広い範囲の相補的アプローチのうちただ一つの道具である。本単一施設研究を用いて,スペクトルの異なるBRCA1/2のミスセンス変異体のin silico分析の影響を評価することを目的とした。を疑う遺伝性乳癌および卵巣癌(HBOC)を持つ523屈折率患者におけるBRCA1/2の変異解析を行った。遺伝的変異体の分類はドイツコンソーシアム(GC)-HBOCデータベースに従って行った。さらに,すべてミスセンス変異体は以下の三in silico予測ツール(SIFT,Mutation Taster(MT2)とPolyPhen2(PPh2)により分類した。全体として201種の変異体,そのうちの68個はミスセンス変異体を構成し,病原性,中性,または未知の順位であった。in silicoツールによるミスセンス変異体の分類はGC HBOC分類と比較した病原性変異(25% vs. 13.2%)のより高い量をもたらした。まとめると,ミスセンス変異体の五十%以上(38/68, 55.9%)は異なって格付けされた。突然変異予測のためのin silicoツールの感度は88.9%(PPh2),100%(SIFT)と100%(MT2)であった。in silico予測ツールを用いて,癌リスクの潜在的過大評価や過小評価となる変異体分類に関連する相違を見出した。より信頼性の高い,特に遺伝子特異的,予測ツールと機能試験は臨床カウンセリングを改善するために必要である。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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分類 (5件):
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女性生殖器と胎児の腫よう  ,  酵素一般  ,  遺伝的変異  ,  遺伝学研究法  ,  分子遺伝学一般 
タイトルに関連する用語 (4件):
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