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J-GLOBAL ID：201702234309316208   整理番号：17A1247857

Pugionium cornutum(L.)Gaertnのde novo組立と分析トランスクリプトームと同定乾燥応答に関与する遺伝子【Powered by NICT】

De novo assembly and analysis of the Pugionium cornutum (L.) Gaertn. transcriptome and identification of genes involved in the drought response

著者 (3件)： Wang Ping (College of Agronomy, Inner Mongolia Agricultural University, Inner Mongolia Autonomous Region Key Laboratory of Wild Peculiar Vegetable Germplasm Resource and Germplasm Enhancement, Huhhot 010019, China) ,  Wang Fengfeng (College of Agronomy, Inner Mongolia Agricultural University, Inner Mongolia Autonomous Region Key Laboratory of Wild Peculiar Vegetable Germplasm Resource and Germplasm Enhancement, Huhhot 010019, China) ,  Yang Jing (College of Agronomy, Inner Mongolia Agricultural University, Inner Mongolia Autonomous Region Key Laboratory of Wild Peculiar Vegetable Germplasm Resource and Germplasm Enhancement, Huhhot 010019, China)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 626  ページ： 290-297  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Pugionium cornutum(L.)Gaertn.は中国北西部の砂砂漠生息地に広く分布している乾生植物種である。しかし,P.cornutumの乾燥耐性の分子機構はほとんど注目されていない。現在,公開されているデータベースにおけるP.cormutumに利用できるトランスクリプトーム情報は限られている。Illumina配列決定は干ばつ応答性遺伝子を同定し,P.cornutumの乾燥耐性の分子的基礎をさらに特性化するために使用した。全部で825.32bpの平均長さは51,385個の単遺伝子がde novoトランスクリプトーム集合により得られた。これらユニジーンのうち,35,276名は遺伝子記述,保存されたドメイン,遺伝子オントロジー用語,代謝経路と注釈された。添加では,結果は,差次的に発現した遺伝子(DEG)は主に光合成,窒素代謝,植物ホルモンシグナル伝達経路,特にアスコルビン酸とaldarate代謝,乾燥ストレスに応答してそれはP.cornutumの抗酸化能を高めるための代替経路で関与することを示した。これらの結果は,P.cornutum中のアスコルビン酸生合成に及ぼすROSの蓄積の影響についての重要な手がかりを提供する。添加では,アスコルビン酸代謝に関与するほとんどの遺伝子の転写は,乾燥ストレス下で変化したことを見出した。それに加えて,93種の干魃誘導性転写因子遺伝子が乾燥条件下でDEGを同定した;DREB,AP2/EREBP,B2a,ERF2,MYB及びジンクフィンガーファミリーを含んでいた。本研究の結果は,P.cornutumのストレス耐性の分子機構へのさらなる洞察を提供し,遺伝子工学による他の種における乾燥ストレス耐性を改善するためのいくつかの魅力的な候補遺伝子と貴重な情報を同定した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 光合成 ,  *トランスクリプトーム ,  キャラクタリゼーション ,  データベース ,  *遺伝子 ,  転写因子 ,  植物ホルモン ,  干ばつ ,  中華人民共和国 ,  代謝経路 ,  耐干性 ,  ラクトン ,  水溶性ビタミン ,  第二アルコール ,  ポリオール
準シソーラス用語： ストレス耐性 ,  乾燥ストレス ,  分子機構 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Pugionium cornutum(L.)。 ,  干ばつストレスの応答 ,  イルミナシーケンシング ,  トランスクリプトーム

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (1件)： アスコルビン酸

タイトルに関連する用語 (6件)： 組立 ,  分析 ,  トランスクリプトーム ,  同定 ,  応答 ,  遺伝子