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J-GLOBAL ID：201702234917352269   整理番号：17A0984974

マルチオミックスデータの統合による腫瘍モデルとしての細胞株の最適化

Optimization of cell lines as tumour models by integrating multi-omics data

著者 (8件)： ZHAO Ning (Harbin Medical Univ.) ,  LIU Yongjing (Harbin Medical Univ.) ,  WEI Yunzhen (Harbin Medical Univ.) ,  YAN Zichuang (Harbin Medical Univ.) ,  ZHANG Qiang (Harbin Medical Univ.) ,  WU Cheng (Harbin Medical Univ.) ,  CHANG Zhiqiang (Harbin Medical Univ.) ,  XU Yan (Harbin Medical Univ.)
資料名： Briefings in Bioinformatics  (Briefings in Bioinformatics)
巻： 18  号： 3  ページ： 515-529  発行年： 2017年05月 
JST資料番号： W2342A  ISSN： 1467-5463  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 2005年から細胞株の評価に用いられてきた方法について検証した。The Cancer Genome AtlasおよびCancer CellLine Encyclopediaからの遺伝子発現,コピー数および突然変異プロファイルを用いて,腫瘍と細胞株の間の類似性を計算した。この結果を遺伝子オントロジーの機能的類似性と組み合わせることにより,8種類のタイプの癌の実験のための理想的な細胞株が得られた。検証により,最適な細胞株は同種腫瘍試料と同じゲノム特性を有していることが分かった。先行研究において認められた他の細胞が混入した細胞株も,ことin vitro癌モデルに適していないことが分かった。本研究により,一般的に用いられている細胞株の一部は癌のモデルに適していないことが示唆された。以上より,今後の癌研究の正確さの改善に役立つin vitro実験で用いる理想的な細胞株の基準が示され,より有効な治療法の発見のための基礎が得られた。

シソーラス用語： 培養細胞 ,  分子生物学 ,  *腫瘍 ,  *モデル ,  *最適化 ,  データ融合 ,  遺伝子 ,  オントロジー ,  ゲノム
準シソーラス用語： オミックス ,  *データ統合 ,  *マルチオミックス ,  遺伝子オントロジー ,  癌 ,  *細胞株

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (6件)： マルチオミックス ,  統合 ,  腫瘍 ,  モデル ,  細胞株 ,  最適化