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J-GLOBAL ID：201702234979178154   整理番号：17A1218325

Dunaliella salinaのde novoトランスクリプトームプロファイリングは相互塩分変化に及ぼすグリセロール代謝経路の調和流を明らかにする【Powered by NICT】

De novo transcriptomic profiling of Dunaliella salina reveals concordant flows of glycerol metabolic pathways upon reciprocal salinity changes

著者 (8件)： Fang Lei (Marine Biology and Collaborative Innovation Center of Deep Sea Biology, Ocean College, Zhejiang University, Zhoushan, ZJ 316000, China) ,  Qi Shuyuan (Marine Biology and Collaborative Innovation Center of Deep Sea Biology, Ocean College, Zhejiang University, Zhoushan, ZJ 316000, China) ,  Xu Zhenyu (Marine Biology and Collaborative Innovation Center of Deep Sea Biology, Ocean College, Zhejiang University, Zhoushan, ZJ 316000, China) ,  Wang Wei (Zhejiang Provincial Key Laboratory for Microbial Biochemistry and Metabolic Engineering and College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, ZJ 310058, China) ,  He Jing (Ocean Research Centre of Zhoushan, Zhejiang University, ZJ 316021, China) ,  Chen Xin (Zhejiang Provincial Key Laboratory for Microbial Biochemistry and Metabolic Engineering and College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, ZJ 310058, China) ,  Liu Jianhua (Marine Biology and Collaborative Innovation Center of Deep Sea Biology, Ocean College, Zhejiang University, Zhoushan, ZJ 316000, China) ,  Liu Jianhua (Ocean Research Centre of Zhoushan, Zhejiang University, ZJ 316021, China)
資料名： Algal Research  (Algal Research)
巻： 23  ページ： 135-149  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3154A  ISSN： 2211-9264  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： グリセロール含有量の調節はDunaliella salinaにおける塩分変化への適応に重要である。しかし,塩分変化にグリセロール代謝に関与する酵素をコードする遺伝子の転写調節は議論の余地がある。この問題に対処するために,著者らはde novoで平均700被覆を用いたIllumina社のPE90戦略を用いてD.salinaトランスクリプトームを構築した。最適成長条件の範囲内で逆塩分変化に応答したD.salina細胞のトランスクリプトームプロファイリング分析は,塩分増加と減少に全6700注釈付き経路の330試料からおよび553個の差別的に転写されたEST(発現配列タグ)を示した。は両条件下で130種の一般的な差別的に転写されるESTのほぼ全てが塩分相関転写応答を示すを見出した。グリセロールとその潜在的炭素源の代謝に関与する三十三の酵素に基づいて,10の一般的な差別的に転写されるESTのうち8が重要な部位で酵素をコードしていると思われる。クラスター分析により,33種の酵素のうち28は塩分変化に応答して塩分相関転写プロファイルを示すことを示唆した。酵素の転写プロファイルは塩分変化にグリセロール代謝の流れと完全に一致した。この結果はグリセロール及び澱粉含量は塩分と正に相関し,負であるという観察と一致した。さらに,光合成糖は塩分減少に役立つ優先的に示し,光合成糖は,澱粉蓄積ではなくグリセロール合成のための優先的な炭素源であることを示唆した。まとめると,著者らの解析は,最適成長条件の範囲内で逆塩分変化に応答して転写プロファイリングは,D.salinaの塩分特異的応答性ESTを濃縮することを示した。これらの条件下で,転写調節はグリセロールの代謝とD.salinaにおけるその潜在的炭素源に関与する酵素活性の制御における明確な役割を果たしていることを示すことができた。osmobalancingの転写調節は,他の耐塩性単細胞生物において進化的に保存されている可能性があることを提案した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 光合成 ,  クラスタ分析 ,  酵素 ,  *トランスクリプトーム ,  *塩分 ,  酵素活性度 ,  遺伝子 ,  澱粉 ,  耐塩性 ,  脂肪族アルコール ,  ポリオール
準シソーラス用語： 転写プロファイリング ,  炭素源 ,  転写調節 ,  *グリセロール代謝 ,  *Dunaliella salina , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  微生物生理一般  (EG03051L)

物質索引 (1件)： グリセロール

タイトルに関連する用語 (5件)： Dunaliella ,  塩分 ,  グリセロール ,  代謝経路 ,  調和