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J-GLOBAL ID：201702235291920053   整理番号：17A2005523

適応実験室内進化に由来する大腸菌K-12の高速成長表現型は細胞内流束再配線を必要としない【Powered by NICT】

Fast growth phenotype of E. coli K-12 from adaptive laboratory evolution does not require intracellular flux rewiring

著者 (7件)： Long Christopher P. (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, Metabolic Engineering and Systems Biology Laboratory, University of Delaware, Newark, DE 19716, USA) ,  Gonzalez Jacqueline E. (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, Metabolic Engineering and Systems Biology Laboratory, University of Delaware, Newark, DE 19716, USA) ,  Feist Adam M. (Department of Bioengineering, University of California, San Diego, CA 92093, USA) ,  Feist Adam M. (Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability, Technical University of Denmark, 2800 Lyngby, Denmark) ,  Palsson Bernhard O. (Department of Bioengineering, University of California, San Diego, CA 92093, USA) ,  Palsson Bernhard O. (Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability, Technical University of Denmark, 2800 Lyngby, Denmark) ,  Antoniewicz Maciek R. (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, Metabolic Engineering and Systems Biology Laboratory, University of Delaware, Newark, DE 19716, USA)
資料名： Metabolic Engineering  (Metabolic Engineering)
巻： 44  ページ： 100-107  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1646A  ISSN： 1096-7176  CODEN： MEENFM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 順応型実験室進化(ALE)は,選択された環境条件における微生物の適応度を改善するために広く使用されている方法である。グルコース最小培地,よく使われているモデル生物と成長条件に好気的指数増殖における大腸菌K-12MG1655へ以前に適用した,E.coli成長速度の限界を調べ,高速増殖表現型への洞察を得ることであった。以前の研究は,ALEに続く成長率の1.6倍までの増加を記述し,転写パターンの重要な原因遺伝子変異と変化を同定した。ここでは,六つのこのような適応的に進化した株の細胞内代謝フラックスを初めて報告し,高分解能~13C-代謝フラックス解析により決定した。興味深いことに,細胞内代謝経路利用は適応進化後ほとんど変化することを見出した。代わりに,中心炭素代謝のレベルでより速い成長はグルコース取込と全細胞内速度の比例増加によって促進された。ここで研究した六進化した株のうち,1株のみが小程度フラックス再配線のを示し,これはユニークな遺伝的変異を持つ株であった。BW25113およびBL21,他の二種の野生型(unevolved)E.coli株とフラックスの比較は系統間差は親及び進化株間で相違よりも大きいことを示した。主成分分析により,九系統間のほぼ全てのフラックス差(95%)はわずか二主成分により捕捉されたことを明らかにした。測定とフラックスバランス解析予測フラックス間の距離も調べた。は比較的広い範囲類似の化学量論最適,適応進化の経路依存性に関する新しい疑問を開くことを示唆した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 順応 ,  代謝経路 ,  *表現型 ,  成長速度 ,  最少培地 ,  主成分分析 ,  *大腸菌 ,  好気性 ,  化学量論 ,  野生型 ,  ヘキソース ,  アルドース
準シソーラス用語： 遺伝的変異 ,  炭素代謝 ,  適応進化 ,  代謝流束 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 適応進化 ,  Escherichia coli ,  代謝フラックス解析 ,  フラックスバランス解析 ,  高速成長

分類 (1件)： 代謝と栄養  (EG03054K)

物質索引 (1件)： グルコース

タイトルに関連する用語 (7件)： 適応 ,  実験室内進化 ,  大腸菌 ,  K-12 ,  成長 ,  表現型 ,  流束