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J-GLOBAL ID：201702235748076664   整理番号：17A0430080

エンドウ(Pisum sativum L.)における種子の無機栄養素濃度と含量に関するゲノムワイドSNP同定,連鎖地図作製とQTLマッピング

Genome-wide SNP identification, linkage map construction and QTL mapping for seed mineral concentrations and contents in pea (Pisum sativum L.)

著者 (7件)： MA Yu (Washington State Univ., WA, USA) ,  COYNE Clarice J (ARS, USDA, WA, USA) ,  GRUSAK Michael A (ARS, USDA, TX, USA) ,  MAZOUREK Michael (Cornell Univ., NY, USA) ,  CHENG Peng (Univ. Missouri, MO, USA) ,  MAIN Dorrie (Washington State Univ., WA, USA) ,  MCGEE Rebecca J (ARS, USDA, WA, USA)
資料名： BMC Plant Biology (Web)  (BMC Plant Biology (Web))
巻： 17  号： Feb  ページ： 17:43 (WEB ONLY)  発行年： 2017年02月 
JST資料番号： U7027A  ISSN： 1471-2229  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:マーカー利用育種は,より効率の良い品種育成を進めるために,主要作物では日常的に使用されている。これは,目標となる形質に関連する遺伝子座やマーカーを同定するための次世代シークエンシング技術の利用によって著しく容易になってきた。世界で最も古い栽培作物のひとつであるエンドウ(Pisum sativum L.)は,蛋白質,無機栄養素,炭水化物,いくつかのビタミンなどの栄養成分が豊富である一方で,ゲノムと遺伝資源の利用性では他の多く作物よりも遅れている。エンドウ種子の無機栄養成分レベルをさらに向上させるには,ゲノムワイドツールの開発が必要である。本研究の目的は,これらのツールの開発について,ジェノタイピングバイシークエンシング(GBS)によるゲノムワイド一塩基多型(SNP)の同定,高密度連鎖地図と他のマメ科植物との比較地図の作製,種子におけるホウ素,カルシウム,鉄,カリウム,マグネシウム,マンガン,モリブデン,リン,硫黄と亜鉛のレベルならびに種子重量の量的形質遺伝子座(QTL)の同定によって行うことであった。結果:本研究では,1609個の優良SNPが,F6由来の組換え自殖系(RIL)集団の2親である「キフリカ」と「アラゴーン」間の多型であることがわかった。これまでの報告による75個のマーカーと本研究で開発された1608個のSNPを含む1683個のマーカーのマッピングによって,1310.1cMの連鎖地図が作製された。他のマメ科植物との比較マッピングによって,エンドウとMedicago truncatula(タルウマゴヤシ)のゲノム間で最高レベルのシンテニーが観察されることが示された。2試験地にわたるRIL集団のQTL解析では,無機栄養形質の各々について少なくとも1つのQTLが明らかになった。合計で,46の種子無機栄養素濃度QTL,37の種子無機栄養素含量QTLと6の種子重量QTLが見出された。これらのQTLは,表現型変異の2.4%~43.3%を説明した。結論:本研究で開発されたゲノムワイドSNPと遺伝的連鎖地図は,エンドウの無機栄養素のQTL同定を可能にし,今後,エンドウ育種プログラムにおける栄養品質形質のためのマーカー利用選抜(MAS)を可能にする重要な資源として有用となろう。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *エンドウ ,  種子 ,  一塩基多型 ,  *連鎖地図 ,  *量的形質遺伝子座 ,  ヌクレオチド配列 ,  重量 ,  配列相同性 ,  分離育種 ,  ウマゴヤシ属 ,  解析 ,  独立栄養
準シソーラス用語： Medicago truncatula ,  ジェノタイピングバイシークエンシング ,  シンテニー ,  マーカー利用選抜 ,  遺伝子マッピング ,  次世代シークエンシング ,  種子重量 ,  QTL解析 ,  無機栄養素

分類 (2件)： 豆類  (FC03035U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (11件)： エンドウ ,  Pisum ,  種子 ,  無機栄養素 ,  含量 ,  ゲノム ,  SNP ,  同定 ,  連鎖地図 ,  作製 ,  QTLマッピング