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J-GLOBAL ID：201702236213526303   整理番号：17A1101144

annotatr 文脈中のゲノム領域

annotatr: genomic regions in context

著者 (2件)： CAVALCANTE Raymond G. (Univ. Michigan, MI, USA) ,  SARTOR Maureen A. (Univ. Michigan, MI, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 15  ページ： 2381-2383  発行年： 2017年08月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 次世代シーケンシングデータ分析により生ずるゲノム領域を注釈づけするための既存のツールは,注釈づけソースや柔軟な選択肢の欠如,注釈づけのためにかかる時間,簡単にデータを要約するための視覚化の選択肢が無いといった欠点を持つ。本稿ではゲノム領域の注釈づけを柔軟かつ迅速に要約し描く,annotatr Bioconductorパッケージを紹介する。annotatrは,http://bioconductor.org/packages/annotatr/およびhttps://github. com/rcavalcante/annotatrにて利用可能である。

シソーラス用語： ヌクレオチド配列 ,  *データ解析 ,  遺伝学実験技術 ,  *プログラムパッケージ ,  *遺伝子座
準シソーラス用語： *次世代シーケンシング ,  データ分析 ,  *分子配列アノテーション ,  *ゲノム領域

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (2件)： 文脈 ,  ゲノム