文献

J-GLOBAL ID：201702236532544967   整理番号：17A1491059

16S rRNAとcpn60遺伝子配列の解析は潜在的に有用なと有害油田微生物叢に関する補完的な情報を提供する【Powered by NICT】

Analyses of 16S rRNA and cpn60 gene sequences provide complementary information about potentially useful and harmful oil field microbiota

著者 (10件)： Kryachko Yuriy (National Research Council Canada, 110 Gymnasium Place, Saskatoon SK, S7N 0W9, Saskatoon, SK, Canada) ,  Semler Diana (Dycor Technologies Ltd., Edmonton, AB, Canada) ,  Vogrinetz John (Dycor Technologies Ltd., Edmonton, AB, Canada) ,  Lemke Markus (Dycor Technologies Ltd., Edmonton, AB, Canada) ,  Irvine Randy (Independent Contractor, Calgary, AB, Canada) ,  Davidson John (Independent Contractor, Calgary, AB, Canada) ,  Links Matthew G. (Department of Animal and Poultry Science, University of Saskatchewan, Saskatoon, SK, Canada) ,  McCarthy E. Luke (National Research Council Canada, 110 Gymnasium Place, Saskatoon SK, S7N 0W9, Saskatoon, SK, Canada) ,  Haug Brenda (National Research Council Canada, 110 Gymnasium Place, Saskatoon SK, S7N 0W9, Saskatoon, SK, Canada) ,  Hemmingsen Sean M. (National Research Council Canada, 110 Gymnasium Place, Saskatoon SK, S7N 0W9, Saskatoon, SK, Canada)
資料名： International Biodeterioration & Biodegradation  (International Biodeterioration & Biodegradation)
巻： 123  ページ： 320-327  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0518A  ISSN： 0964-8305  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： カナダ油田における五坑井からの微生物群集は配列16S rRNAとcpn60遺伝子アンプリコンによって特性化した。RDPipelineとフェニックス2パイプラインを用いた16S rRNAアンプリコン配列の解析により,Ralstonia,Arcobacter,Sulfurospirillum,Methanohalophilus,MethanocalculusとMethanolobus spp.を表すアンプリコンはほとんどの試料で豊富であったことを示した。Bacillusといくつかの他の属由来のアンプリコンは試料においても検出された。cpn60配列の分析はSulfurospirillum,Methanolobus及びBacillus spp.由来のアンプリコンをよく表すことを確認した,Bacillus mojavensisを産生するバイオサーファクタントと非常に類似した細菌はBacillus属を示した。さらに,cpn60配列の分析は,特にPelobacter carbinolicus,Deltaproteobacteriaから誘導されたアンプリコンが豊富であったことを示した。cpn60配列の分析は,アンプリコンRalstonia spp.を表すまたは他の代表Betaproteobacteriaの,可能性のあるPCRバイアスを示すを検出できなかった。著者らの知見は,16S rRNAとcpn60遺伝子増幅と分析システムの欠点から生じるギャップはこれらの保存された遺伝子の同時標的化によって大幅に改善されることを示唆した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *油田 ,  ターゲティング ,  バイオサーファクタント ,  *ミクロフローラ ,  *微生物 ,  *遺伝子 ,  遺伝子増幅 ,  桿菌属 ,  カナダ ,  Ralstonia ,  メタン生成細菌 ,  キャラクタリゼーション
準シソーラス用語： アンプリコン ,  *遺伝子配列 ,  *16S rRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 分類学的同定 ,  シャペロニン-60 ,  バイオサーファクタント ,  微生物影響腐食 ,  メタン生成細菌 ,  プライマーバイアス

分類 (2件)： 微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C) ,  代謝と栄養  (EG03054K)

タイトルに関連する用語 (6件)： rRNA ,  遺伝子配列 ,  解析 ,  油田 ,  微生物叢 ,  補完