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J-GLOBAL ID：201702236532623452   整理番号：17A0270971

モウソウチク(Phyllostachys edulis)におけるAAAP遺伝子ファミリーのゲノムワイド解析

Genome-Wide analysis of the AAAP gene family in moso bamboo (Phyllostachys edulis)

著者 (7件)： LIU Huanlong (Anhui Agricultural Univ.) ,  WU Min (Anhui Agricultural Univ.) ,  ZHU Dongyue (Anhui Agricultural Univ.) ,  PAN Feng (Anhui Agricultural Univ.) ,  WANG Yujiao (Anhui Agricultural Univ.) ,  WANG Yue (Anhui Agricultural Univ.) ,  XIANG Yan (Anhui Agricultural Univ.)
資料名： BMC Plant Biology (Web)  (BMC Plant Biology (Web))
巻： 17  号： Jan  ページ： 17:29 (WEB ONLY)  発行年： 2017年01月 
JST資料番号： U7027A  ISSN： 1471-2229  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:アミノ酸/オーキシンパーミアーゼ(AAAP)遺伝子ファミリーのメンバーは,様々な植物代謝および生合成プロセスにおいて不可欠な役割を果たす。シロイヌナズナや,イネや,トウモロコシおよびポプラではAAAP遺伝子の包括的分析が行われているが,モウソウチクからは報告されていない。モウソウチク(Phyllostachys edulis)におけるAAAP遺伝子ファミリーの系統学や,進化パターンおよびさらなる発現プロファイル分析は,この重要な遺伝子ファミリーに対する理解を増加させるだろう。結果:本研究では,現存するモウソウチクゲノム配列に基づいて,モウソウチクの55個の予測AAAP遺伝子の系統発生や,遺伝子構造や,プロモーター領域や,分岐時間や,発現パターンおよびqRT-PCR解析を実施した。モウソウチクの55個の配列や,イネの58個の配列,およびトウモロコシの71個の配列を含む184個の全長蛋白質配列を用いた比較系統解析に基づいて,8つの異なるサブファミリーに分けられる,55個の推定AAAP(PeAAAP1-55)遺伝子を同定した。進化パターンと分岐の解析から,PeAAAP遺伝子は約1200万年前(MYA)の広範な重複事象を経験しており,モウソウチクとイネのAAAPファミリー遺伝子間の分岐は約27MYAであった。マイクロアレイ分析は,いくつかの遺伝子がモウソウチクの成長および発育においてかなりの役割を果たすことを示唆した。qRT-PCRにより非生物的ストレス(干ばつや,塩分および寒冷)下での16のAAPサブファミリー遺伝子の発現レベルを調査して,モウソウチクにおける個々のPeAAAP遺伝子のストレス応答への潜在的寄与を調査した。結論:この研究の結果は,PeAAAP遺伝子が,特に非生物的ストレス条件に応答して,モウソウチクの成長および発育において重要な役割を果たすことを示唆している。モウソウチクにおけるAAAP遺伝子ファミリーの包括的かつ系統的な研究は,植物におけるAAAP遺伝子の機能および進化のさらなる分析を容易にするであろう。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *マダケ属 ,  パーミアーゼ ,  アミノ酸輸送 ,  *系統発生 ,  遺伝子発現 ,  遺伝子重複 ,  RT-PCR法 ,  定量的PCR法 ,  植物成長 ,  遺伝学実験技術 ,  系統樹 ,  イネ ,  トウモロコシ ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： *モウソウチク ,  *アミノ酸/オーキシンパーミアーゼ ,  アミノ酸輸送体 ,  qRT-PCR法 ,  近隣結合法

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： モウソウチク ,  Phyllostachys ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  解析