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J-GLOBAL ID：201702236572686597   整理番号：17A0143004

Alzheimer病におけるRNA-seqとマイクロアレイを用いた差動共発現ネットワーク【Powered by NICT】

Differential Co-Expression Networks using RNA-seq and microarrays in Alzheimer’s disease

著者 (3件)： Hyojin Kang (Department of Convergence Technology Research, Korea Institute of Science and Technology Information (KISTI), Daejeon, Korea) ,  Junehawk Lee (Department of Convergence Technology Research, Korea Institute of Science and Technology Information (KISTI), Daejeon, Korea) ,  Seokjong Yu (Department of Convergence Technology Research, Korea Institute of Science and Technology Information (KISTI), Daejeon, Korea)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2016  号： BIBM  ページ： 1907-1908  発行年： 2016年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 示差共発現ネットワーク(DCENs)は実験条件または遺伝的変化に応答して差次的共発現パターンを示す遺伝子のグラフ表現である。条件特異的モジュールを同定し,遺伝子調節ネットワークの動的変化の画像を提供するために成功裏に適用された。DCENs解析は条件間で各遺伝子対の発現相関変化を計算することにより遺伝子相互接続間の差異を調べた。本研究では,アルツハイマー病のヒト脳と血液由来の25種のRNA-seqと2,102マイクロアレイ試料を含むNCBI GEOからの多くの異なるデータセットを収集し,アルツハイマー病の特性化に関与する機能的モジュールを同定するための微分共発現解析を行った。DCENsはPearson相関係数を用いて発生させたとメタ分析は,ランクベース法を用いて行った。予備的な結果はDCENsの構造特性は,Alzheimer病の基礎となる遺伝子調節動力学への新しい洞察を提供することができることを示した。マイクロアレイとRNA seq派生DCENs間が,RNA-seqからDCENsはRNA-seqの高被覆率とダイナミックレンジによるマイクロアレイからのものを補完するであろう低サイズ重なりがある。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： ダイナミックレンジ ,  キャラクタリゼーション ,  構造特性 ,  遺伝 ,  *ネットワーク ,  ヒト ,  *Alzheimer病 ,  被覆率 ,  遺伝子 ,  *RNA【核酸】 ,  メタ分析 ,  遺伝子調節ネットワーク ,  *共発現 ,  *マイクロアレイ ,  遺伝子発現調整
準シソーラス用語： 遺伝的調節 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： Alzheimer病 ,  RNA-seq ,  マイクロアレイ ,  差動 ,  共発現