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J-GLOBAL ID：201702236731872780   整理番号：17A1464430

尿素輸送体dvUT中の尿素分子のフラックス,結合と置換のモデル化【Powered by NICT】

Modeling of flux, binding and substitution of urea molecules in the urea transporter dvUT

著者 (9件)： Zhang Hai-Tian (Department of Physics, Wuhan University, Wuhan 430072, China) ,  Wang Zhe (Department of Physics, Wuhan University, Wuhan 430072, China) ,  Wang Zhe (Department of Physics and Department of Medical Imaging, Jianghan University, Wuhan 430056, China) ,  Yu Tao (Department of Physics, Wuhan University, Wuhan 430072, China) ,  Yu Tao (Department of Physics and Department of Medical Imaging, Jianghan University, Wuhan 430056, China) ,  Sang Jian-Ping (Department of Physics, Wuhan University, Wuhan 430072, China) ,  Sang Jian-Ping (Department of Physics and Department of Medical Imaging, Jianghan University, Wuhan 430056, China) ,  Zou Xian-Wu (Department of Physics, Wuhan University, Wuhan 430072, China) ,  Zou Xiaoqin (Dalton Cardiovascular Research Center, Department of Physics and Astronomy, Department of Biochemistry and Informatics Institute, University of Missouri, Columbia, MO 65211, United States)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 76  ページ： 504-511  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 尿素輸送体(UT)は,細胞膜を横切る尿素分子を輸送し,尿素排せつと水収支において重要な役割を果たしていることを膜貫通蛋白質である。UTの機能特性は,どのように構造物が原子レベルでの機能を理解することを助け,UTを標的とする将来の治療設計を容易にする。本研究では,Desulfovibrio vulgaris尿素輸送体(dvUT)の結晶構造に基づいている。dvUT中の尿素分子の結合挙動をモデル化するために,協同的結合モデルを構築した。dvUTにおける尿素類似体N,N′-ジメチル尿素(DMU)による尿素の置換をモデル化するために,尿素細孔に沿ってDMUの占有確率と外部(S_ext)と内部(S_int)結合部位でのDMUの占有確率の比を計算し,著者らは,尿素とDMUの結合と置換のための相互置換則を確立した。これら計算とモデリングに基づいて,モンテカルロ(MC)法を用いて,著者らはさらにdvUTにおける尿素フラックス,dvUT平衡尿素結合,dvUTにおけるDMUによる尿素の置換をモデル化した。著者らのモデル化の結果を既存の実験関数データと良く一致した。さらに,モデリングは,これら機能的特性の微視的過程と機構を発見した。方法と結果は,これらの疾患の治療のための障害UT関数と合理的薬物設計に関連した疾患の根底にある機構の我々の将来の理解に役立つであろう。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *モデリング ,  結合モデル ,  膜貫通タンパク質 ,  治療法 ,  細胞膜 ,  計算機シミュレーション ,  細孔 ,  Desulfovibrio vulgaris ,  結合部位 ,  構造物 ,  結晶構造 ,  モンテカルロ法 ,  ウレア化合物
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  分子モデリング ,  *尿素輸送体 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 分子モデリング ,  分子動力学シミュレーション ,  モンテカルロ法 ,  膜蛋白質 ,  尿素輸送体

分類 (2件)： オペレーションズリサーチ一般  (KA03010Q) ,  酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： 尿素

タイトルに関連する用語 (6件)： 尿素輸送体 ,  尿素 ,  分子 ,  フラックス ,  置換 ,  モデル化