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J-GLOBAL ID：201702237186491232   整理番号：17A0307006

磁気共鳴スペクトル定量再現性保証のためのjMRUIソフトウェアにおけるトラッキング処理

Processing tracking in jMRUI software for magnetic resonance spectra quantitation reproducibility assurance

著者 (4件)： JABLONSKI Michal (Inst. of Scientific Instruments, CAS) ,  JABLONSKI Michal (Masaryk Univ.) ,  STARCUKOVA Jana (Inst. of Scientific Instruments, CAS) ,  STARCUKJR. Zenon (Inst. of Scientific Instruments, CAS)
資料名： BMC Bioinformatics (Web)  (BMC Bioinformatics (Web))
巻： 18  号： Jan  ページ： 18:56 (WEB ONLY)  発行年： 2017年01月 
JST資料番号： U7025A  ISSN： 1471-2105  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:プロトン磁気共鳴分光法は,非侵襲的測定技術であり,細胞内生化学プロセスに関与する最大20の代謝産物の濃度に関する情報を提供する。測定されたスペクトルから任意の代謝情報を得るために,jMRUIなどの特殊なソフトウェアで処理を行なう必要がある。処理は対話的かつ複雑であり,正しい結果を得る前に多くの試行を必要とすることが多い。本論文では,効率的で明確な履歴追跡とファイル識別のためのjMRUI拡張を提案する。結果:処理に使用されるすべての処理ステップや,パラメータ,およびファイルを格納するデータベースがjMRUI用に開発された。このソリューションはJavaで開発され,著者らは,パラメータの堅牢な格納にSQLデータベースを使用し,明白なファイル識別のためにSHA-256ハッシュコードを使用した。開発されたシステムはjMRUIに直接統合され,一般に公開される。ユーザエクスペリエンスをより快適にするために,グラフィカルユーザーインターフェイスが実装された。データベース操作は共通ユーザの視点からは不可視であり,すべての追跡操作はバックグラウンドで実行される。結論:実装されたjMRUIデータベースは,ユーザがjMRUIのデータに対して実行された処理履歴を追跡するのに役立つツールである。作成されたツールは,ユーザーフレンドリで堅牢で使いやすいように設計されている。データベースGUIは,ユーザが選択したファイルの全処理履歴を閲覧し,例えば,元のデータが格納されている結果の処理にどのような処理が行われ,スペクトルに対して実行されたすべての処理アクションのリストが取得できる。データベースGUIにより,ユーザは選択したファイルの処理履歴全体を閲覧し,どの処理が結果につながるか,どこに元のデータが格納されているか学習し,スペクトルに対して実行されたすべての処理動作のリストを取得することができる。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *スペクトル ,  *ソフトウェア ,  *代謝産物 ,  *定量分析 ,  *データベース ,  *SQL【ソフトウェア】 ,  信号処理 ,  *再現性 ,  追跡 ,  計算機ファイル ,  GUI【計算機】
準シソーラス用語： *jMRUIソフトウェア ,  ユーザエクスペリエンス ,  ユーザフレンドリ ,  *核磁気共鳴スペクトル

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (5件)： 定量 ,  再現性 ,  保証 ,  ソフトウェア ,  トラッキング