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J-GLOBAL ID：201702237405686099   整理番号：17A1545589

細胞内細菌Piscirickettsia salmonisによる感染中のタイセイヨウサケのマイクロRNAベースのトランスクリプトーム応答【Powered by NICT】

MicroRNA-based transcriptomic responses of Atlantic salmon during infection by the intracellular bacterium Piscirickettsia salmonis

著者 (4件)： Valenzuela-Miranda Diego (Laboratory of Biotechnology and Aquatic Genomics, Interdisciplinary Center for Aquaculture Research (INCAR), University of Concepcion, P. O. Box 160-C, Concepcion, Chile) ,  Valenzuela-Munoz Valentina (Laboratory of Biotechnology and Aquatic Genomics, Interdisciplinary Center for Aquaculture Research (INCAR), University of Concepcion, P. O. Box 160-C, Concepcion, Chile) ,  Farlora Rodolfo (Laboratorio de Biotecnologia Acuatica y Genomica Reproductiva/Instituto de Biologia, Facultad de Ciencias Universidad de Valparaiso, Chile) ,  Gallardo-Escarate Cristian (Laboratory of Biotechnology and Aquatic Genomics, Interdisciplinary Center for Aquaculture Research (INCAR), University of Concepcion, P. O. Box 160-C, Concepcion, Chile)
資料名： Developmental and Comparative Immunology  (Developmental and Comparative Immunology)
巻： 77  ページ： 287-296  発行年： 2017年 
JST資料番号： T0151A  ISSN： 0145-305X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マイクロRNA(miRNA)は分類群を越えた多様な生物学的過程の重要な制御因子として出現した低分子非コードRNAである。しかし,これら転写物の重要性にもかかわらず,ほとんどはサケ科魚類の免疫応答におけるそれらの役割知られていない。のために,チリにおけるサケ水産養殖への細胞内細菌Piscirickettsia salmonis,主な脅威の一つに対する大西洋サケ(Salmo salar)のマイクロRNAに基づくトランスクリプトーム応答を調べるために大規模シークエンシング技術を用いた。,594種類のmiRNAが頭腎と脾臓トランスクリプトームデータから同定した。それらの中で,miRNAファミリーmIr181mIr143及びmir-21は対照群で最も豊富であったが,P.salmonis,mir-21による感染後,mIr181とmir30は最も支配的な系統であった。さらに,転写解析は,それぞれ,分析した組織の間の10のmiRNAの重複応答と頭腎と脾臓で84と25特異的に発現するmiRNAを明らかにした。,GO濃縮分析と結合した,標的予測は,大抵の規制されたmiRNAの可能性のある標的は免疫応答に関与する遺伝子,コルチゾール代謝,ケモカインシグナル伝達経路と好中球走化性遺伝子のようなことを明らかにした。これらの中で,C-Cモチーフケモカイン19のような,間質細胞由来因子1様,ミクソウイルス耐性蛋白質2とヘプシジン-1のような予測された推定標的遺伝子を同定した。全体として,著者らの結果は,標的遺伝子の転写活性を有する共変調におけるmiRNA発現は細胞内細菌性病原体に対するタイセイヨウサケの免疫応答における非コードRNAの推定上の役割に関連していることを示唆した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *感染 ,  遺伝子 ,  脾臓 ,  *Salmo salar ,  タンパク質 ,  養殖 ,  代謝 ,  病原体 ,  免疫反応 ,  *トランスクリプトーム ,  ケモカイン
準シソーラス用語： 標的遺伝子 ,  頭腎 ,  *マイクロRNA ,  *細胞内細菌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： miRNA ,  非コードRNA ,  Salmo salar ,  免疫応答 ,  Piscirickettsia salmonis

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  魚類  (FH02020K)

タイトルに関連する用語 (7件)： 細胞内細菌 ,  Piscirickettsia ,  感染 ,  タイセイヨウサケ ,  マイクロRNA ,  トランスクリプトーム ,  応答