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J-GLOBAL ID：201702238218429809   整理番号：17A1126335

ゲノムスケール代謝モデルの再構築とpolymalic酸生産者のin silico解析Aureobasidium pullulans M2012223をCCTCCM202019【Powered by NICT】

Reconstruction of a genome-scale metabolic model and in silico analysis of the polymalic acid producer Aureobasidium pullulans CCTCC M2012223

著者 (8件)： Feng Jun (College of Pharmaceutical Sciences, Chongqing Engineering Research Center for Pharmaceutical Process and Quality Control, Southwest University, Chongqing 400715, PR China) ,  Yang Jing (College of Pharmaceutical Sciences, Chongqing Engineering Research Center for Pharmaceutical Process and Quality Control, Southwest University, Chongqing 400715, PR China) ,  Li Xiaorong (College of Pharmaceutical Sciences, Chongqing Engineering Research Center for Pharmaceutical Process and Quality Control, Southwest University, Chongqing 400715, PR China) ,  Guo Meijin (State Key Laboratory of Bioreactor Engineering, East China University of Science & Technology, Shanghai 200237, PR China) ,  Wang Bochu (Key Laboratory of Biorheological Science and Technology (Chongqing University), Ministry of Education, Chongqing 400044, PR China) ,  Yang Shang-tian (William G. Lowrie Department of Chemical and Biomolecular Engineering, The Ohio State University, Columbus, OH 43210, USA) ,  Zou Xiang (College of Pharmaceutical Sciences, Chongqing Engineering Research Center for Pharmaceutical Process and Quality Control, Southwest University, Chongqing 400715, PR China) ,  Zou Xiang (Key Laboratory of Biorheological Science and Technology (Chongqing University), Ministry of Education, Chongqing 400044, PR China)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 607  ページ： 1-8  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Aureobasidium pullulansは,例えばポリリンゴ酸(PMA)とプルランを生体高分子を生成するために用い酵母様真菌である。,A.pullulans産M2012223,高いPMA産生株は著者らの以前の研究で分離し,配列を決定した。その代謝性能を理解するために,iZX637,637遺伝子,1347反応と1133種の代謝物からなる,ゲノムスケール代謝モデルをゲノムアノテーションと文献マイニング研究に基づいて再構築した。iZX637モデルはA.pullulansの細胞成長,炭素源および窒素源の利用,遺伝子の必須性解析をシミュレートすることにより検証した。は,著者らのモデルを検証し,実験データを用いてPMA生産を予測するためのシミュレーションプログラムを設計し,さらにPMA合成速度の増加とともに炭素フラックス分布と変化を解析した。計算した磁束分布により,NADPH及びNADH依存性メチレンテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼ(MTHFD)は代謝ネットワークにおけるNADHを補うためのNADHへのNADPH由来還元当量の移動と関連していることが分かった。さらに,高いPMA合成率の下で,大量の炭素フラックスは,還元的TCAサイクルを介したリンゴ酸へのピルビン酸によるものであった。CO_2固定によるオキサロ酢酸へのピルビン酸を変換する,ピルビン酸カルボキシラーゼもPMA合成のための重要な標的である可能性がある。これらの結果は,モデルiZX637はA.pullulans代謝の最適化と誘導代謝工学のための標的の同定のための強力なツールであることを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 細胞増殖 ,  *代謝 ,  最適化 ,  遺伝子 ,  *再構成 ,  クエン酸サイクル ,  代謝産物 ,  脂肪族ケトン ,  脂肪族カルボン酸 ,  ケト酸 ,  アデニンヌクレオチド ,  ニコチンアミドヌクレオチド ,  ジヌクレオチド
準シソーラス用語： 代謝工学 ,  代謝ネットワーク ,  炭素フラックス ,  炭素源 ,  *Aureobasidium pullulans , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 生体高分子 ,  代謝工学 ,  ピルビン酸カルボキシラーゼ ,  還元剤

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

物質索引 (3件)： ピルビン酸 ,  NADH ,  NADPH

タイトルに関連する用語 (8件)： ゲノム ,  スケール ,  代謝 ,  モデル ,  再構築 ,  酸 ,  解析 ,  Aureobasidium