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J-GLOBAL ID：201702238568334768   整理番号：17A1240583

植生勾配にまたがる協同的に繁殖する熱帯鳥類における適応のゲノムフットプリント【Powered by NICT】

Genomic footprints of adaptation in a cooperatively breeding tropical bird across a vegetation gradient

著者 (7件)： Termignoni-Garcia Flavia (Department of Zoology, National Collection of Birds (CNAV), Institute of Biology, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, CdMx, Mexico) ,  Jaramillo-Correa Juan P. (Department of Evolutionary Ecology, Institute of Ecology, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, CdMx, Mexico) ,  Chable-Santos Juan (Department of Zoology, Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, Universidad Autonoma de Yucatan, Yucatan, Mexico) ,  Liu Mark (Biodiversity Research Center, Academia Sinica, Taipei, Nankang, Taiwan) ,  Shultz Allison J. (Department of Organismic and Evolutionary Biology (OEB), Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Edwards Scott V. (Department of Organismic and Evolutionary Biology (OEB), Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Escalante-Pliego Patricia (Department of Zoology, National Collection of Birds (CNAV), Institute of Biology, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, CdMx, Mexico)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 26  号： 17  ページ： 4483-4496  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 環境と表現型変異との関係の遺伝的基礎の同定は局所適応はどのように進化したかを理解するための鍵。このようなパターンは生息地勾配を横断して分布する個体群の間で特に興味深い,遺伝構造は距離(IBD)および/または環境による分離(IBE)による分離によって駆動されることができる。ここでは,二重消化制限部位関連DNA(ddRAD Seq)のペアエンドシーケンシングから誘導された約1,600個の高品質SNPの変化を使用したユカタンカケス(Cyanocorax yucatanicus)におけるIBDとIBEに関連した仮説,ユカタン半島に固有の熱帯鳥類を試験した。半島は常緑熱帯この種における形態学的変化と関連している森林に乾燥勾配から降水量と植生によって特性づけられている。は中程度レベルのヌクレオチド多様性(π=.008)と植生タイプ間の遺伝的分化の証拠は見出せなかった。中性及び推定適応SNP(相補的ゲノムスキャン法により同定された)の解析からは,炎症性腸疾患(IBD)は前者の頻度分布を説明するために最も信頼できる説明であることを示し,一方,IBEは後者のそれを説明するのに引用されていない。これらの結果は,植生勾配に沿って作用する選択的因子は移動,非移動性と地理的に制限された種における遺伝子流動の存在下での局所適応を促進することができることを示唆した。ここで同定された候補SNP内または将来のゲノム調査のための理想的な標的であることを種々の遺伝子に関連した位置していた。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  半島 ,  地理学 ,  *熱帯 ,  モルフォロジー ,  生息場所 ,  表現型 ,  個体群 ,  *ゲノム ,  遺伝
準シソーラス用語： 遺伝子流動 ,  ユカタン半島 ,  遺伝的構造 ,  局所適応 ,  表現型変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 適応遺伝的変異 ,  遺伝子型環境と表現型の関連 ,  距離によるisolation ,  環境によるisolation ,  ユカタンカケス

分類 (2件)： 個体群生態学  (EE03030S) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (9件)： 植生 ,  勾配 ,  協同 ,  繁殖 ,  熱帯 ,  鳥類 ,  適応 ,  ゲノム ,  フットプリント