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J-GLOBAL ID：201702238603183050   整理番号：17A1004435

HiC-spector Hi-C接触マップのスペクトルおよび再現性解析のためのマトリックスライブラリー

HiC-spector: a matrix library for spectral and reproducibility analysis of Hi-C contact maps

著者 (5件)： YAN Koon-Kiu (Yale Univ., CT, USA) ,  YARDIMCI Galip Guerkan (Univ. Washington, WA, USA) ,  YAN Chengfei (Yale Univ., CT, USA) ,  NOBLE William S. (Univ. Washington, WA, USA) ,  GERSTEIN Mark (Yale Univ., CT, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 14  ページ： 2199-2201  発行年： 2017年07月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Hi-Cのようなゲノムワイド近接ライゲーションに基づくアッセイは,ゲノム三次元構造への窓を開いてきた。このようなアッセイは,通常の一次元信号検出と異なるデータ構造を示す。Hi-C接触マップの二次元性質を利用するため,スペクトル分析のようなマトリックス技術が有用である。本報告では,Hi-C接触マップを解析するためのマトリックス関連機能のコレクションを示した。特に,スペクトル分解に基づいた接触マップの間の相同性を定量するための再現性計量を紹介した。

シソーラス用語： *ゲノムワイド関連解析 ,  *ゲノム ,  *分析 ,  *地図 ,  *分光分析 ,  *再現性 ,  酵素反応 ,  リガーゼ ,  構造 ,  三次元 ,  信号検出 ,  データ構造 ,  スペクトル分解 ,  相同性
準シソーラス用語： *アッセイ ,  *マップ ,  *スペクトル分析 ,  ライゲーション ,  三次元構造

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  医用画像処理  (JE04020T) ,  分光分析  (CC03012W)

タイトルに関連する用語 (8件)： HIC ,  Hi-C ,  マップ ,  スペクトル ,  再現性 ,  解析 ,  マトリックス ,  ライブラリー