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J-GLOBAL ID：201702238648859095   整理番号：17A1097510

薬剤耐性の検出のためのMycobacterium tuberculosisの全ゲノム配列決定:系統的レビュー【Powered by NICT】

Whole genome sequencing of Mycobacterium tuberculosis for detection of drug resistance: a systematic review

著者 (7件)： Papaventsis D. (National Reference Laboratory for Mycobacteria, Sotiria Chest Diseases Hospital, Athens, Greece) ,  Casali N. (Department of Medicine, Imperial College London, London, UK) ,  Kontsevaya I. (Department of Medicine, Imperial College London, London, UK) ,  Drobniewski F. (Department of Medicine, Imperial College London, London, UK) ,  Cirillo D.M. (Division of Immunology, Transplantation and Infectious Diseases, IRCCS San Raffaele Scientific Institute, Milan, Italy) ,  Nikolayevskyy V. (Department of Medicine, Imperial College London, London, UK) ,  Nikolayevskyy V. (PHE National Mycobacterium Reference Laboratory, London, UK)
資料名： Clinical Microbiology and Infection  (Clinical Microbiology and Infection)
巻： 23  号： 2  ページ： 61-68  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3155A  ISSN： 1198-743X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らは,第一および第二選択抗結核(TB)薬に対する抵抗性の検出のためのMycobacterium tuberculosisの全ゲノムシークエンシング(WGS)の診断精度を決定するために系統的レビューを行った。研究は系統的レビュー群のための好ましい報告アイテムの基準に従って行った。全20件の文献を対象とした。参照標準として表現型薬剤感受性試験法を用いたWGSの感度,特異性,正の予測値と負の予測値を決定した。試験した抗TB剤は全ての第一選択薬,予備薬物,新薬の多様性を含んでいた。全部で53遺伝子の多型は薬剤耐性との関連を試験した。選択した第一選択薬に対する耐性を検出するためのプールされた感度と特異性値はイソニアジドに対するリファンピシンと0.97(95% CI 0.94 0.99)と0.93(95% CI 0.91 0.96)0.98(95% CI 0.93 0.98)と0.98(95% CI 0.98 1.00)であった。研究デザインにおける高い不均一性,データの欠如,抵抗性メカニズムの知識と系統発生マーカーの排除に透明度のために,残りの第一選択,予約薬と新薬のWGSの分析性能における著しい変動があった。全ゲノム配列決定は,リファンピシンおよびイソニアジド分析パイプラインの標準化側鎖をのための既存の表現型及び分子薬剤感受性試験法の有望な代替であると考えられる。M.tuberculosis複合体薬物耐性を検出するためのWGSの臨床的関連性を確実にするために,今後の研究は臨床転帰に関する情報を含むべきである。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *薬物耐性 ,  新薬 ,  結核 ,  不均一性 ,  *結核菌 ,  標準化 ,  遺伝子 ,  系統発生 ,  *システマティックレビュー ,  表現型 ,  窒素複素環化合物
準シソーラス用語： 転帰 ,  特異性 ,  薬剤感受性試験 ,  *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 薬剤耐性 ,  遺伝子多型 ,  実験室診断 ,  性能特性 ,  結核 ,  全ゲノム配列決定

分類 (3件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  微生物検査  (GC02030H) ,  抗細菌薬の基礎研究  (GW17020S)

物質索引 (1件)： イソニアジド

タイトルに関連する用語 (4件)： 薬剤耐性 ,  Mycobacterium ,  ゲノム配列 ,  系統的レビュー