文献

J-GLOBAL ID：201702238687920819   整理番号：17A1498546

2状態遺伝子発現モデルにおける蛋白質レベル分布を近似するための効率的で仮定なし法【Powered by NICT】

An efficient and assumption-free method to approximate protein level distribution in the two-states gene expression model

著者 (5件)： Xu Bingxiang (CAS Key Laboratory of Genome Sciences and Information, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, People’s Republic of China) ,  Xu Bingxiang (University of Chinese Academy of Sciences, People’s Republic of China) ,  Ge Hao (Beijing International Center for Mathematical Research (BICMR) and Biodynamic Optical Imaging Center (BIOPIC), Peking University, Beijing 100871, People’s Republic of China) ,  Zhang Zhihua (CAS Key Laboratory of Genome Sciences and Information, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, People’s Republic of China) ,  Zhang Zhihua (University of Chinese Academy of Sciences, People’s Republic of China)
資料名： Journal of Theoretical Biology  (Journal of Theoretical Biology)
巻： 433  ページ： 1-7  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0288B  ISSN： 0022-5193  CODEN： JTBIA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子発現の各ステップでの確率的ゆらぎは,細胞集団を横切る蛋白質レベル分布に影響するかもしれない。しかし,固有の遺伝子発現動力学のモデル蛋白質分布に現在の方法は計算的に非効率か,例えば,遺伝子は常に活性であることをアドホック仮定に依存している。分布の低次モーメントの簡単な形式を利用して,効率的で仮定なし蛋白質分布近似法(EFPD)を開発し,分布を精確に近似する二状態遺伝子発現モデル。EFPDにより,mRNAと蛋白質レベルでの遺伝子発現調節のほぼ同じ強度を計算し,転写と翻訳間の重要なリンクを示唆した。最後に,任意の時間的状態での蛋白質レベルの分布を近似するためにEFPD拡張により,連続的に変化する環境の文脈における遺伝子発現における確率的ノイズの役割の説明を提案した。EFPDは標的遺伝子発現パターンの特定の分子機構をモデル化するための強力なツールである。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： モデリング ,  モーメント ,  雑音 ,  近似法 ,  *遺伝子発現 ,  *タンパク質 ,  mRNA ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 分子機構 ,  遺伝子発現パターン ,  遺伝子発現調節 ,  細胞凝集体 ,  確率的摂動 ,  *蛋白質量 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 固有の遺伝子発現動力学 ,  モーメントベース密度近似 ,  遺伝子発現調節

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 遺伝子発現 ,  モデル ,  蛋白質レベル ,  分布 ,  近似 ,  仮定 ,  法