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J-GLOBAL ID：201702238859315308   整理番号：17A1480315

アミロイド-βの本質的に無秩序なペプチドアンサンブル上の常磁性スピン標識の影響【Powered by NICT】

Effect of a Paramagnetic Spin Label on the Intrinsically Disordered Peptide Ensemble of Amyloid-β

著者 (6件)： Sasmal Sukanya (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of California, Berkeley, Berkeley, California) ,  Lincoff James (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of California, Berkeley, Berkeley, California) ,  Head-Gordon Teresa (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of California, Berkeley, Berkeley, California) ,  Head-Gordon Teresa (Department of Chemistry, University of California, Berkeley, Berkeley, California) ,  Head-Gordon Teresa (Department of Bioengineering, University of California, Berkeley, Berkeley, California) ,  Head-Gordon Teresa (Pitzer Center for Theoretical Chemistry, University of California, Berkeley, Berkeley, California)
資料名： Biophysical Journal  (Biophysical Journal)
巻： 113  号： 5  ページ： 1002-1011  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0298A  ISSN： 0006-3495  CODEN： BIOJAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 常磁性緩和増強は折畳まれた蛋白質の構造への重要な洞察が得られたことをNMR技法であり,本質的に無秩序な蛋白質(IDP)の構造アンサンブルの特性化に適用した場合,大きなスピンプローブにより導入された摂動は,その有用性を減少させると考えられるかもしれなかった。IDPアミロイド-β42(Aβ42)の計算発生した構造集団を比較したシステインに結合したニトロキシドスピン標識はそのN末端に導入されている代替配列した。この内部的に一貫した計算比較に基づいて,スピン標識は,Aβ42参照集団における支配的であることを残基16 21と29 36により形成されたβ-ヘアピンの特徴集団を混乱させないことを見出した。しかし,タグの存在は元のAβ42構造亜集団のサブセットでの強い個体群シフトを誘導し,残基27 31と33 38により形成されたβヘアピンの7倍増強を含む。計算構造アンサンブルからのNMRオブザーバブルの計算により,縦緩和への常磁性寄与は実際の実験におけるNOE強度を抑制しなければ標識および非標識ペプチド間の構造的差異は局所残留双極子結合で明らかであり,おそらく等核~1H~1H核Overhauser効果(NOE)及び異核~1H~15N NOEの違いであることを示した。本研究では,分子シミュレーションは,IDPに適用する常磁性緩和増強,二重電子-電子共鳴,蛍光共鳴エネルギー移動実験の解釈を助けることが可能であることをレポータータグにより導入された潜在的構造摂動を解決するための相補的アプローチを提供することを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *スピン標識 ,  キャラクタリゼーション ,  *アミロイド ,  スピン-格子緩和 ,  ニトロキシド ,  タンパク質 ,  摂動 ,  *常磁性 ,  *ペプチド ,  NMR【磁気共鳴】 ,  脂肪族アミン ,  チオール ,  脂肪族カルボン酸 ,  含硫アミノ酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 残留双極子結合 ,  アミロイドβ42 ,  スピンプローブ ,  常磁性緩和 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

物質索引 (1件)： システイン

タイトルに関連する用語 (5件)： アミロイド ,  ペプチド ,  アンサンブル ,  常磁性 ,  スピン標識