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J-GLOBAL ID：201702239023343322   整理番号：17A1130839

SNaPショットベースmtDNA調節領域タイピングに関する共同EDNAP運動【Powered by NICT】

A collaborative EDNAP exercise on SNaPshot-based mtDNA control region typing

著者 (34件)： Weiler N.E.C. (Netherlands Forensic Institute, The Hague, The Netherlands) ,  Baca K. (Forensic Bureau The Internal Security Agency, Warsaw, Poland) ,  Ballard D. (Faculty of Life Sciences and Medicine, King’s College London, London, UK) ,  Balsa F. (Forensic Genetics Service, Centre Branch, National Institute of Legal Medicine and Forensic Sciences, Coimbra, Portugal) ,  Bogus M. (Institute of Legal Medicine, Medical Faculty, University of Cologne, Germany) ,  Borsting C. (Section of Forensic Genetics, Department of Forensic Medicine, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Denmark) ,  Brisighelli F. (Forensic Genetics Laboratory, Institute of Legal Medicine, Universita Cattolica del Sacro Cuore, Rome, Italy) ,  Cervenakova J. (Department of Biology and DNA Analysis, Institute of Forensic Science, Kosice, Slovakia) ,  Chaitanya L. (Department of Genetic Identification, Erasmus MC University Medical Center Rotterdam, Rotterdam, The Netherlands) ,  Coble M. (Applied Genetics Group National Institute of Standards and Technology, Gaithersburg, United States) ,  Decroyer V. (National Institute of Criminalistics and Criminology, Brussels, Belgium) ,  Desmyter S. (National Institute of Criminalistics and Criminology, Brussels, Belgium) ,  van der Gaag K.J. (Netherlands Forensic Institute, The Hague, The Netherlands) ,  Gettings K. (Applied Genetics Group National Institute of Standards and Technology, Gaithersburg, United States) ,  Haas C. (Zurich Institute of Forensic Medicine, University of Zurich, Switzerland) ,  Heinrich J. (Institute of Legal Medicine, Innsbruck Medical University, Innsbruck, Austria) ,  Joao Porto M. (Forensic Genetics Service, Centre Branch, National Institute of Legal Medicine and Forensic Sciences, Coimbra, Portugal) ,  Kal A.J. (Netherlands Forensic Institute, The Hague, The Netherlands) ,  Kayser M. (Department of Genetic Identification, Erasmus MC University Medical Center Rotterdam, Rotterdam, The Netherlands) ,  Kudelova A. (Department of Biology and DNA Analysis, Institute of Forensic Science, Kosice, Slovakia) ,  Morling N. (Section of Forensic Genetics, Department of Forensic Medicine, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Denmark) ,  Mosquera-Miguel A. (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Science, Genomic Medicine Group, University of Santiago de Compostela, Spain) ,  Noel F. (National Institute of Criminalistics and Criminology, Brussels, Belgium) ,  Parson W. (Institute of Legal Medicine, Innsbruck Medical University, Innsbruck, Austria) ,  Parson W. (Forensic Science Program, The Pennsylvania State University, University Park, PA, United States) ,  Pereira V. (Section of Forensic Genetics, Department of Forensic Medicine, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Denmark) ,  Phillips C. (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Science, Genomic Medicine Group, University of Santiago de Compostela, Spain) ,  Schneider P.M. (Institute of Legal Medicine, Medical Faculty, University of Cologne, Germany) ,  Syndercombe Court D. (Faculty of Life Sciences and Medicine, King’s College London, London, UK) ,  Turanska M. (Department of Biology and DNA Analysis, Institute of Forensic Science, Slovenska Lupca, Slovakia) ,  Vidaki A. (Faculty of Life Sciences and Medicine, King’s College London, London, UK) ,  Wolinski P. (Forensic Bureau The Internal Security Agency, Warsaw, Poland) ,  Zatkalikova L. (Department of Biology and DNA Analysis, Institute of Forensic Science, Slovenska Lupca, Slovakia) ,  Sijen T. (Netherlands Forensic Institute, The Hague, The Netherlands)
資料名： Forensic Science International: Genetics  (Forensic Science International: Genetics)
巻： 26  ページ： 77-84  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3148A  ISSN： 1872-4973  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 共同ヨーロッパDNAプロファイリング(EDNAP)集団運動はミトコンドリア(mt)DNA制御領域における18個の一塩基多型(SNP)位置を標的とし,主要なヨーロッパmtDNAハプログループの識別を可能にすることを以前述べSNaPshotベーススクリーニングアッセイ(ミニmtSNaPshot)(Weiler.,2016)[1]の性能を評価した。組織検査に加えて,14法医学遺伝学研究所が13試料の分析,中央に調製して,徹底的に出荷前に試験したに関与していた。試料は可変複雑性と簡単な構成単一源試料,脱落あるいは変化したピークサイジングによる試料点ヘテロプラスミーおよび二成分混合物五対立遺伝子呼に1をもたらした。有用な結果を得るために全体の成功率は,参加研究室のいくつかはタイピング技術および/またはmtDNA分析による以前の経験を持たないことを与えられた高(97.6%)。わずか18SNPをタイピングした時には参加者の大部分はハプロタイプ推論しハプログループを割り当てると系統学的一貫性をチェックする実現可能性を評価した。ケースワーク手順を模倣するために,参加者は全13試料のSNPタイピングデータを比較し標準命名法(Parson.,2014)[2]に従い述べた八mtDNA参照プロファイルのセットにと,これらの参考文献を各試料と一致したかどうかを示した。不正確なscoringsは比較の2%で得られ,参加者のサブセットから誘導された,ミニmtSNaPshotデータ解釈に関する訓練とガイドラインの必要性を示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 法医学 ,  一塩基多型 ,  対立遺伝子 ,  *粒状材 ,  ハプロタイプ ,  ミトコンドリア ,  組織診 ,  ヨーロッパ ,  *DNA【核酸】
準シソーラス用語： SNP解析 ,  ヘテロプラスミー ,  ハプログループ ,  DNA鑑定 ,  *タイピング ,  *ミトコンドリアDNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 裁判科学 ,  mtDNA ,  SNaPショット ,  ハプログループ ,  超並列配列決定

分類 (2件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  個体群生態学  (EE03030S)

タイトルに関連する用語 (7件)： SNAP ,  ショット ,  mtDNA ,  調節領域 ,  タイピング ,  共同 ,  運動