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J-GLOBAL ID：201702239180587648   整理番号：17A0343879

広東(MORUS ATROPURPUREA)の葉緑体ゲノムにおける配列解析と構造解析を行った。【JST・京大機械翻訳】

High-throughput Sequencing and Structural Analysis of Chloroplast Genome of Morus atropurpurea

著者 (3件)： Li Qiaoli (College of Forestry, Northwest A & F University) ,  Yan Na (College of Forestry, Northwest A & F University) ,  Guo Junzhan (College of Forestry, Northwest A & F University)
資料名： Canye Kexue  (Canye Kexue)
巻： 42  号： 6  ページ： 953-959  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2131A  ISSN： 0257-4799  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 葉緑体ゲノムの構造と組成は比較的保守的で,その配列断片の変異体速率適において,植物の系統進化の研究に適している。中国の主要な栽培品種であるMORUS MORUS(MORUS の)の品種サルビアを実験材料とし、ILLUMINAハイスループット配列決定プラットフォームを用いて、広東の葉緑体の全ゲノム配列を分析し、ゲノム構造を分析した。さらに既報の近縁種の葉緑体ゲノムと比較した。広東遺伝子の長さは159BPであり,2つの逆反復領域(IRAとIRB)の長さは25BPであり,大単(LSC)と小(SSC)によって分離された。LSCとSSCのサイズは,それぞれ87BPと19BPであった。葉緑体ゲノムには130個の遺伝子があり、85個のタンパク質のコード遺伝子、37個のTRNA遺伝子と8個のRRNA遺伝子が含まれ、その中にイントロンを含む遺伝子の数は24個であり、22個の遺伝子は1個のイントロンしか含まれていない。2つの遺伝子(YCF3とCLPP)は2つのイントロンを含む。広東の葉緑体ゲノムのゲノム数,種類およびCG含量は他の桑植物の葉緑体ゲノムと類似していた。83の単純反復配列(SSR)遺伝子座を,バイオインフォマティクス解析により広東省の葉緑体ゲノムにおいて検出し,ヌクレオチド,ジヌクレオチド,トリヌクレオチド,トリヌクレオチド,およびトリヌクレオチド反復モチーフの数はそれぞれ60,8,3,10,2であり,6ヌクレオチド反復配列は見つからなかった。多くのサイトはAまたはTからなる。4つの桑種を含む14の種を,MEGA6.0ソフトウェアを用いて,最尤法および法によって,葉緑体 MORUS(MORUS)として同定した。インドクワ(MORUS INDICA)と川桑(MORUS NOTABILIS)はポリ。これらの結果は,葉緑体ゲノムの工学的研究と桑属種の間の分子マーカーの開発と優れた品種の育成のための参照価値がある。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ゲノム ,  *葉緑体 ,  遺伝子 ,  品種 ,  最尤法 ,  系統発生 ,  イントロン ,  *構造解析 ,  ヌクレオチド ,  栽培品種
準シソーラス用語： トリヌクレオチド ,  バイオインフォマティクス ,  ゲノム配列 ,  *配列解析 ,  *葉緑体ゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Morus atropurpurea ,  Chloroplast genome ,  High-throughput sequencing ,  Cluster analysis

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： Morus ,  葉緑体ゲノム ,  配列解析 ,  構造解析